[发明专利]SATB2蛋白作为结肠直肠癌标记的应用

说明书

本申请是申请日为2007年6月4日，申请号为200780020492.9，发明名称为“SATB2蛋白作为结肠直肠癌标记的应用”的发明专利申请的分案申请。

技术领域

本发明涉及癌症诊断和预后领域。具体而言，它提供了一种通过鉴别作为结肠直肠癌的标记的SATB2蛋白来用于检测和鉴定结肠直肠癌的新方法。

背景技术

SATB2

编码富含AT的特殊序列结合蛋白2(special AT-rich sequence-binding protein2,SATB2)的基因是在1999年人类基因组测序的浩大工程中被鉴别出的(Kikuno R et al(1999)DNA Res.6:197-205)。自此，SATB2基因被认为主要在神经组织中表达。

SATB2是一个形成核基质各部分的转录因子，并且它通过与富含AT的序列（也称为基质结合区(MARs)）相互作用来调控高度有序的染色质（high-order chromatin）结构从而进行组织特异性的基因表达(Dickinson LA et al(1992)Cell70,631-45;FitzPatrick DR et al(2003)Hum.Mol.Genet.12,2491-501;Yasui D,(2002)Nature419,641-5;Bode,J(2000)Crit.Rev.Eukaryot.Gene.Expr.10,73-90)。

对该基因及其蛋白产物SATB2蛋白的研究，指出它作为转录因子在神经组织中参与基因表达的调控(Dobreva G et al(2003)Genes Dev.17:3048-3061;Britanova O et al(2005)Eur.J.Neurosci.21:658-668)。还有记载，SATB2基因在腭发育和腭裂中起作用(FitzPatrick DR et al(2003)Human Mol.Genet.12:2491-2501;van Buggenhout G et al(2005)Eur.J.Med.Genet.48:276-289)。

Salahshor等人对一名腺瘤性结肠息肉病(APC)基因突变的患者进行了研究(Salahshor et al(2005)BMC cancer5:66)。APC患者在年轻时产生异常量的结肠腺瘤，如果不治疗，最终将发展成结肠直肠癌。总基因表达谱揭示了一组包括SATB2在内的84个基因在腺瘤内的表达相比在正常粘膜中有显著改变。SATB2被发现显著下调但未被选用于做进一步的分析。Int J Cancer上关于结肠直肠癌表达图谱的新近研究同样指出SATB2在mRNA水平上的表达状态有所改变(Groene J et al(2006)Int J Cancer119,1829-1836)。

PCT公布文本WO03/022126和WO2006/015742描述了关于癌细胞表达图谱的其他相似研究。对包括SATB2的大量基因的表达进行分析并根据总的表达模式得出结论。

重要地是，上述研究并未提供关于SATB2蛋白作为特异的结肠直肠标记的应用或SATB2作为结肠直肠癌预后工具的应用的暗示。

癌症

癌症是西方最常见的疾病和死亡原因之一。一般而言，大多数的癌症形式的发病率是随年龄增加的。因为人类总体健康状况提高所致的寿命的继续增长，患癌症的个体会更多。尽管日益增加的知识指出环境因素（饮食、烟草、紫外线等）及遗传因素（“癌症基因”如p53、APC、BRCA1、XP等的种系突变）与癌症的发病风险之间有一种联系，但大多数常见类型的癌症的病因一般来说还不清楚。