[发明专利]与宫颈癌发生相关联的SNP及其用于检测宫颈癌易感人群的方法

说明书

技术领域

本发明涉及妇科肿瘤学和分子遗传学领域，具体地说，本发明涉及与宫颈癌发生相关联的SNP以及这些SNP用于检测宫颈癌易感人群的方法。 

背景技术

宫颈癌是危害妇女健康的恶性肿瘤之一，其在世界范围内的死亡率占到女性恶性肿瘤性疾病的第三位 ¹。每年世界上大约50万新的宫颈癌确诊患者，同时每年有26万8千余人死于宫颈癌²，而上述80％的病例发生在发展中国家³。中国的宫颈癌发病率和死亡率均高居世界的第二位³。目前，宫颈癌的发病率在某些地区出现上升趋势，且患者趋于年轻化。随着社会经济的日益发展，宫颈癌这一危害广大妇女的恶性疾病越来越受到社会各界的关注。对于宫颈癌的发病机制的研究一直是学界的热点之一。近年来的流行病学和分子生物学研究揭示了宫颈癌的发生同高危型人类乳头瘤病毒(HPV)的持续感染存在直接关系^4，5。然而宫颈癌作为一种恶性肿瘤，其发病机制相对复杂，是遗传与环境相互作用的共同结果，除了高危型HPV的持续感染外，遗传因素在宫颈癌的发生中起到不容忽视的重要作用^6，7。因此，宫颈癌易感基因的研究是阐明宫颈癌发病机制的重要线索。 

迄今为止，在恶性肿瘤性疾病相关基因的识别和定位方面所取得的成就并不显著和系统，原因主要在于肿瘤性疾病具有较强的遗传异质性，其发病存在环境和基因交互作用的复杂性，遗传模式的不确定性，以及目前针对恶性肿瘤易感基因研究方法的局限性等。现在，人们已经意识到基因缺陷是很多恶性肿瘤发生的重要原因。以宫颈癌为例，携带疾病易感基因的妇女比不携带疾病易感基因的妇女更可能罹患宫颈癌。当前，如何从遗传角度检测宫颈癌易感基因，判定个体的宫颈癌易感性，并进一步作出风险预测和诊断，是广大医疗卫生人员和科技工作者面临的难题和挑战。尽管国内外对于宫颈癌的易感基因研究已开展多年，但是目前尚未取得全面、系统、详尽的研究成果。 

发明内容

本发明的目的之一是通过全基因组病例/对照关联分析研究揭示与宫颈癌发生相关联的SNP；目的之二是根据上述SNP的遗传变异提出一种判定宫颈癌易感人群的方法。 

本发明是通过以下技术方案实现的： 

与宫颈癌发生相关联的SNP，其特征在于位于人类染色体4q12上的rs13117307多态性位点为T；位于人类染色体6p21.32上的rs4282438多态性位点为G，rs9277952多态性位点为A，rs2116260多态性位点为T，rs3129275多态性位点为A，rs3117008多态性位点为C，rs9391756多态性位点为A，rs213210多态性位点为T，其中与宫颈癌发生独立相关的SNP为rs4282438和rs9277952；位于人类染色体17q12上的rs8067378多态性位点为G。一种与宫颈癌发生相关联的SNP于检测宫颈癌易感人群的方法，其特征是通过以下步骤实现： 

(1)基因组DNA提取，用微量DNA提取试剂盒提取基因组DNA； 

(2)Taqman PCR扩增含SNP位点的目的片段； 

(3)PCR产物荧光采集与基因分型； 

(4)结果判定，根据这一易感基因内SNP位点的差异确定宫颈癌的易感人群。 

本发明内容表明，位于人类染色体4q12上的rs13117307，位于人类染色体6p21.32上的rs4282438、rs9277952、rs2116260、rs3129275、rs3117008、rs9391756、rs213210(其中与宫颈癌发生独立相关的SNP为rs4282438和rs9277952)和位于人类染色体17q12上的rs8067378是与宫颈癌发生相关联的SNP，上述SNP的多态性位点与正常人存在差异，因此与宫颈癌的易感性相关联。即rs13117307多态性位点为 T、rs4282438多态性位点为G、rs9277952多态性位点为A和rs8067378多态性位点为G的人群为宫颈癌的易感人群。