[发明专利]AQP5基因突变体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及AQP5基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及分离编码AQP5突变体的核酸，分离的多肽，筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的方法，筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的系统，用于筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的试剂盒，构建体以及重组细胞。

背景技术

掌跖角化症（Palmoplantar keratoderma，PPK）是一种遗传异质性较强的疾病，临床特点表现为是手掌和脚底表皮增厚。根据临床表型，可将掌跖角化症分成4个亚型：弥漫型、点状、片状、条纹型。弥漫性掌跖角化症可被进一步细分成表皮松懈和非表皮松懈型掌跖角化症。其中一种非表皮松懈掌跖角化症被称为Bothnia型掌跖角化症（PPK type Bothnia，PPKB），这种病最初在两个瑞典家庭中被发现，并被导报在瑞典Bothnia一带流行发病，在两个瑞典城市的流行率高达0.3%到0.55%。PPKB的临床特点包括：弥漫性，表型一致，掌跖角化过度伴角质层肿胀，其中PPKB一个独特的临床表征为：接触水后角质层呈现白色海绵状外观。

PPKB是一种常染色体显性遗传模式疾病，前期通过遗传连锁分析和定位克隆研究，科学家已成功定位到一个14-cM的区域，12q11-12q13。但是，截至目前，PPKB的致病基因仍无报道。

因而，目前对Bothnia型掌跖角化症的研究尤其是致病基因的确定仍有待深入。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的方法。

本发明是基于发明人的下列工作完成的：发明人通过外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了Bothnia型掌跖角化症的一个致病基因及其突变——AQP5基因的c.367A>T突变。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的编码AQP5突变体的核酸。根据本发明的实施例，所述核酸与SEQ ID NO：1相比，具有c.367A>T突变，即相对于野生型AQP5基因，本发明的AQP5基因突变体的第367位碱基从A突变为T。根据本发明的实施例，发明人确定了AQP5基因的突变体，该突变体与Bothnia型掌跖角化症的发病密切相关，从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易患Bothnia型掌跖角化症。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例，与SEQID NO：2相比，所述分离的多肽具有p.N123Y突变，即该突变是由于c.367A>T的杂合错义突变而引起的，具体地，相对于野生型AQP5，本发明的分离的多肽（即AQP5突变体）的第123位N突变为Y。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易患Bothnia型掌跖角化症。

根据本发明的第三方面，本发明提出了一种筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该方法包括以下步骤：从所述生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，具有c.367A>T突变是所述生物样品易患Bothnia型掌跖角化症的指示。通过根据本发明实施例的筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的方法，可以有效地筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品。

根据本发明的第四方面，本发明提出了一种筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的系统。根据本发明的实施例，该系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，是否具有c.367A>T突变，判断所述生物样品是否易患Bothnia型掌跖角化症。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易患Bothnia型掌跖角化症的生物样品。