[发明专利]一种与猪饲料转化效率性状相关的分子标记及检测方法和应用

权利要求书

1.一种与猪饲料转化效率性状相关的分子标记，含有SNP位点，其特征在于，所述的SNP位点位于SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中， SEQ ID NO：1的第516 bp处有一个G516-A516的碱基突变。

2.权利要求1所述的分子标记，其特征在于，分子标记的引物序列为：正向引物: 5' TCATCTCATTTCCCCCTCCCAGC 3'；反向引物: 5'GAAAACTTCACCCAGGCAAACAGAGGCCCTATTTAGC 3'。

3.一种基于权利要求1所述的分子标记的检测方法，其特征在于，其步骤是：

（1）引物序列

Orexin的SNP分型引物:  正向引物: 5' TCATCTCATTTCCCCCTCCCAGC 3'

  反向引物: 5' GAAAACTTCACCCAGGCAAACAGAGGCCCTATTTAGC 3'

（2）PCR扩增条件

PCR反应总体积10μl，其中猪基因组DNA模板1μl，正反向引物各0.2nmol/μl，PCRmix 5μl，最后加入去离子水至总体积10μl；PCR反应条件为：95℃预变性5min后，循环30次95℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸40s；最后72℃延伸5min；PCR产物经2％W/V琼脂糖凝胶电泳检测；

（3）RFLP检测

PCR产物酶切反应体积是10μl ，其中PCR产物5μl，去离子水3.5μl，10×buffer 1μl，限制性内切酶AluⅠ为0.5μl (10U/μl) ，将样品混匀后离心，37℃培养箱放置12h，用3.5%W/V琼脂糖凝胶电泳检测酶切结果，记录基因型，在紫外灯下拍照；

酶切产生三种基因型，GG基因型只有215bp一条带，AA基因型有179bp和36bp两条带，杂合子GA基因型有215bp、179bp和36bp三条带，其中36bp目的带不出现。

4.权利要求1所述的分子标记在猪饲料转化效率性状相关分子标记辅助育种中的应用。

5.权利要求2所述的分子标记的引物序列在猪饲料转化效率性状相关分子标记辅助育种中的应用。