[发明专利]检测核基因组中与表型形状相关基因的方法无效
申请号: | 201310298676.9 | 申请日: | 2013-07-16 |
公开(公告)号: | CN104293892A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
发明(设计)人: | 张德强;王博文;杜庆章 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 吴贵明;张永明 |
地址: | 100083 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 基因组 表型 形状 相关 基因 方法 | ||
1.一种检测核基因组中与表型性状相关基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,测量F1代杂交群体的目标表型性状,选取极端的目标表型性状;
S2,提取所述极端的目标表型性状个体的RNA,采用BSA法分组后构建表达谱基因芯片;
S3,根据所述表达谱基因芯片的信息找出表达有差异的基因,该基因即为核基因组中与目标表型性状相关的基因。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目标表型性状为净光合速率。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,极端的净光合速率个体包括净光合速率高的个体15株,净光合速率低的个体15株。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,提取所述极端的净光合速率个体的RNA每株2mg,所述净光合速率高的个体5株的RNA混为一池,3个生物学重复;所述净光合速率低的个体5株的RNA混为一池,3个生物学重复。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S3中,通过杂交、图像处理、数据标准化对基因芯片进行数据分析,筛选出FC≥2,P<0.05的基因为表达有差异的基因。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,进一步包括:
S4,通过RT-PCR分析所述步骤S3中找出的表达有差异的基因的表达模式,验证基因芯片结果可靠性。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,进一步包括:通过与已知数据库进行比对,对所述步骤S3中找出的表达有差异的基因注释,进行功能分类。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述步骤S1中测量F1代杂交群体的目标表型性状每个个体测量次数大于3次。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,检测材料为杨树。
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