[发明专利]与玉米抗旱性相关的单体型及其分子标记

权利要求书

1.一种利用玉米多态性位点鉴定或辅助鉴定玉米基因型的方法，所述多态性位点为X1、X2、X3、X4和X5五个多态性位点，所述五个多态性位点X1、X2、X3、X4和X5分别对应于玉米基因组DNA中序列表序列1的自5’末端第296位、第539位、第614位和第615位之间、第646位和第649位；

所述五个多态性位点X1、X2、X3、X4和X5依次为下述a)、b)和c)的情况时相对应的基因型为A、B和C：

a)A/A、C/C、无碱基插入/无碱基插入、G/G和G/G；

b)C/C、T/T、插入CAC/插入CAC、1个碱基缺失/1个碱基缺失和C/C；

c)A/C、C/T、无碱基插入/插入CAC、G/1个碱基缺失和G/C；

获得所述基因型A、B和C的方法为检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表序列1自5’末端第779位至第798位的情况，若为序列表序列7所示DNA片段/序列表序列7所示DNA片段，则所述待测玉米的基因型为B；若为缺失/缺失，则所述待测玉米的基因型为A；若为序列表序列7所示DNA片段/缺失，则所述待测玉米的基因型为C；

被确定为基因型为A的待测玉米，其抗旱性高于被确定为基因型为B和C的待测玉米；被确定为基因型为C的待测玉米，其抗旱性高于被确定为基因型为B的待测玉米。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表序列1自5’末端第779位至第798位的情况所使用的PCR引物对为序列表序列3所示的单链DNA和序列表序列4所示的单链DNA；

若所述PCR产物的大小为46bp，则所述待测玉米的基因型为A；若所述PCR产物的大小为66bp，则所述待测玉米的基因型为B；若所述PCR产物的大小为46bp和66bp，则所述待测玉米的基因型为C。

3.一种利用玉米多态性位点鉴定或辅助鉴定玉米基因型的方法，所述多态性位点为X1、X2、X3、X4和X5五个多态性位点，所述五个多态性位点X1、X2、X3、X4和X5分别对应于玉米基因组DNA中序列表序列1的自5’末端第296位、第539位、第614位和第615位之间、第646位和第649位；

所述五个多态性位点X1、X2、X3、X4和X5依次为下述a)、b)和c)的情况时相对应的基因型为A、B和C：

a)A/A、C/C、无碱基插入/无碱基插入、G/G和G/G；

b)C/C、T/T、插入CAC/插入CAC、1个碱基缺失/1个碱基缺失和C/C；

c)A/C、C/T、无碱基插入/插入CAC、G/1个碱基缺失和G/C；

获得所述基因型A、B和C的方法为利用引物对PCR扩增待测玉米的基因组DNA中任意一段含有所述5个多态性位点的DNA片段后测序；

被确定为基因型为A的待测玉米，其抗旱性高于被确定为基因型为B和C的待测玉米；被确定为基因型为C的待测玉米，其抗旱性高于被确定为基因型为B的待测玉米。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述引物对为序列表序列5所示的单链DNA和序列序列6所示的单链DNA。

5.权利要求1-4中任一所述方法在鉴定或辅助鉴定玉米抗旱性中的应用。

6.扩增如下DNA片段Ⅰ或Ⅱ的PCR引物对：

DNA片段Ⅰ：玉米基因组DNA上的任意一段含有序列表序列1自5’末端第778位和第799位核苷酸的DNA片段；

DNA片段Ⅱ：玉米基因组DNA上的任意一段含有权利要求1中所述五个多态性位点的DNA片段；

所述扩增DNA片段Ⅰ的PCR引物对为序列表序列3所示的单链DNA和序列表序列4所示的单链DNA；

所述扩增DNA片段Ⅱ的PCR引物对为序列表序列5所示的单链DNA和序列表序列6所示的单链DNA。