[发明专利]一种与小麦千粒重相关的分子标记及其应用有效
申请号: | 201310311234.3 | 申请日: | 2013-07-23 |
公开(公告)号: | CN104342484A | 公开(公告)日: | 2015-02-11 |
发明(设计)人: | 景蕊莲;岳爱琴;李昂;毛新国;昌小平 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 小麦 千粒重 相关 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种利用小麦多态性位点鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法,所述多态性位点为X和Y两个单核苷酸多态性位点,所述X和Y两个单核苷酸多态性位点分别对应于小麦基因组DNA中序列表序列1自5’末端第1371位和第2450位;
所述X和Y两个单核苷酸多态性位点依次为下述Ⅰ)、Ⅱ)和Ⅲ)的情况时相对应的基因型为A、B和C:
Ⅰ)G/G和G/G;
Ⅱ)G/G和A/A;
Ⅲ)A/A和G/G。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述获得基因型A、B和C的方法包括对待测小麦的基因组DNA中任意一段包括所述2个单核苷酸多态性位点X和Y在内的DNA片段进行PCR扩增,并将该PCR扩增产物进行酶切鉴定的步骤。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增的靶序列为序列表序列1自5’末端第1—2663bp。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增使用的特异性引物对为序列表序列2所示的单链DNA和序列表序列3所示的单链DNA。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述酶切鉴定包括如下步骤:将PCR产物分别用MboII和BsgI酶切,获得酶切产物M和酶切产物B;
若所述酶切产物M为762bp、681bp、465bp、375bp、225bp和155bp的DNA片段,则所述待测小麦在所述X位点为G/G;
若所述酶切产物M为1137bp、681bp、465bp、225bp和155bp的DNA片段,则所述待测小麦在所述X位点为A/A;
若所述酶切产物B为1955bp、510bp和198bp的DNA片段,则所述待测小麦在所述Y位点为G/G;
若所述酶切产物B为1955bp和708bp的DNA片段,则将所述待测小麦候选为在所述Y位点为A/A。
6.权利要求1—5中任一所述方法在鉴定或辅助鉴定小麦千粒重性状中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:
被确定为基因型为C的待测小麦,其千粒重高于被确定为基因型为A和B的待测小麦;被确定为基因型为A的待测小麦,其千粒重高于被确定为基因型为B的待测小麦。
8.扩增如下DNA片段的PCR引物对:小麦基因组DNA上的任意一段包括所述X和Y两个单核苷酸多态性位点在内的DNA片段。
9.根据权利要求8所述的PCR引物对,其特征在于:所述PCR引物对为序列表序列2所示的单链DNA和序列表序列3所示的单链DNA。
10.一种鉴别或辅助鉴别小麦千粒重性状的试剂或试剂盒,其特征在于:所述试剂或试剂盒包括序列表序列2所示的单链DNA、序列表序列3所示的单链DNA、和限制性内切酶MboII和BsgI。
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