[发明专利]水稻转录因子Os05g27980基因CDS序列的应用在审
申请号: | 201310334913.2 | 申请日: | 2013-08-02 |
公开(公告)号: | CN104341522A | 公开(公告)日: | 2015-02-11 |
发明(设计)人: | 刘军;张永兴;李宏宇;刘斌;赵涛;林辰涛 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/62;C12N15/82;C12N1/21;C12N15/11;A01H5/00 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 转录 因子 os05g27980 基因 cds 序列 应用 | ||
技术领域
本发明涉及基因工程领域,具体地说,涉及水稻转录因子Os05g27980基因CDS序列的应用。
背景技术
水稻(Oryza sativa L.)是我国和全世界最重要的三大粮食作物之一,是世界一半以上人口的主食,也是一个重要的功能基因研究的模式植物。与其相关的遗传学和分子生物学研究一直倍受研究者的重视,转录水平的调控是基因表达调控的重要方式。当前水稻增产的研究较依赖于有限的水稻种质资源,传统的杂交育种优势正在逐渐减弱,而水稻转基因技术有可能发掘水稻进一步增产的潜力。
在植物界中,能形成种子的植物约占植物总数的三分之二以上,作为重要的繁殖器官,种子同时也为人们提供食物来源,水稻就是其中的重要代表,种子来源于受精后的胚珠。从分子生物学的角度来说,种子的发育和萌发是一个有次序的、选择性的基因表达过程。而转录因子在基因表达的精确调控中起到了关键性的作用。
LOB(Lateral Organ Boundaries)家族转录因子在侧生组织发育中具有重要的调控功能。LOB基因在从幼苗顶端分裂组织中形成的所有侧生组织的近轴基部表达,并在侧根的基部表达。拟南芥中发现有43个LOB domian基因,被分为2个类别和三个亚类。拟南芥中的LBD基因AS2(ASYMMETRIC LEAVES2)被发现在叶脉络系统的建立中起作用,包括中主叶脉,对称叶片的发育。LBD基因家族有着大约100个氨基酸的保守区域,4个保守的半胱氨酸大多数拟,南芥LBD基因蛋白质序列包含一个盘绕圈结构,其中有4个亮氨酸LXLXLXL序列。
LOB基因编码的蛋白是一个植物特有的,包括一个保守区域(LOB domain),该保守区域存在于其他42个拟南芥蛋白质中,同时也存在于其他植物物种之中。LOB基因在特定的环境下是拟南芥生长需要的,但是缺失LOB基因的拟南芥突变体在标准条件下没有明显的表型,可能存在功能冗余现象。有研究报道LOB基因的异位表达导致叶片和花的大小、形状发生变化,可以导致雄性和雌性不育。
水稻中LOB基因分为两个亚种,其中水稻LBD基因家族中一员ARL1对不定根原基的形成是必要的,它在不定根的形成过程中起着至关重要的作用,虽然ARL1的表达不仅仅局限于不定根。这些研究为我们进一步研究水稻LOB基因家族的功能提供很好的借鉴。目前LOB家族对叶的发育有初步的研究,但是对种子大小形状调控机制的研究及认识很少。
发明内容
本发明的目的是提供水稻转录因子Os05g27980基因CDS序列的应用。
为了实现本发明目的,本发明首先提供一种组成型水稻转录因子,即融合蛋白(VP16)4-Linker-Os05g27980。
其中,VP16为来自单纯疱疹病毒的VP16蛋白,将4个VP16功能域基序融合在一起可构成一类增强子,增强转录因子的功能,从而在转基因植株中出现更明显的表型变化。上述融合蛋白中涉及的(VP16)4,即VP64是由4个VP16蛋白的氨基酸序列以Gly-Ser为间隔形成的融合蛋白,其氨基酸序列和核苷酸序列分别如SEQ ID No.10和SEQ ID No.4所示。
上述融合蛋白中涉及的Linker由39个柔性氨基酸串联而成,其氨基酸序列如SEQ ID No.9所示,编码该Linker的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
上述融合蛋白中涉及的Os05g27980为水稻转录因子Os05g27980,其氨基酸序列如SEQ ID No.2所示,或该序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的具有同等功能的氨基酸序列;水稻转录因子Os05g27980基因的CDS序列为:SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。
本发明还提供编码所述组成型水稻转录因子的基因,以及在严格条件下,可与该基因的核苷酸序列发生杂交的核苷酸序列。
本发明还提供含有编码所述组成型水稻转录因子的基因的载体、工程菌及细胞系。
所述载体的构建方法如下:
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