[发明专利]水稻转录因子Os03g55990基因CDS序列的应用在审
申请号: | 201310334977.2 | 申请日: | 2013-08-02 |
公开(公告)号: | CN104341524A | 公开(公告)日: | 2015-02-11 |
发明(设计)人: | 刘斌;李宏宇;赵涛;刘军;林辰涛 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/62;C12N15/82;C12N1/21;C12N15/11;A01H5/00 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 转录 因子 os03g55990 基因 cds 序列 应用 | ||
技术领域
本发明涉及基因工程领域,具体地说,涉及水稻转录因子Os03g55990基因CDS序列的应用。
背景技术
水稻(Oryza sativa L.)是我国和全世界最重要的三大粮食作物之一,是世界一半以上人口的主食,也是一个重要的功能基因研究的模式植物。与其相关的遗传学和分子生物学研究一直倍受研究者的重视,转录水平的调控是基因表达调控的重要方式。当前水稻增产的研究较依赖于有限的水稻种质资源,传统的杂交育种优势正在逐渐减弱,而水稻转基因技术有可能发掘水稻进一步增产的潜力。
在植物界中,能形成种子的植物约占植物总数的三分之二以上,作为重要的繁殖器官,种子同时也为人们提供食物来源,水稻就是其中的重要代表,种子来源于受精后的胚珠。从分子生物学的角度来说,种子的发育和萌发是一个有次序的、选择性的基因表达过程。而转录因子在基因表达的精确调控中起到了关键性的作用。
近些年,有关籽粒大小性状的分子遗传调控机制研究,已取得了一定进展,例如研究人员利用QTL定位了一些籽粒大小相关基因,其中GS3编码一个膜蛋白,是籽粒大小和器官大小的负调控因子;张启发等(Yibo Li,Chuchuan Fan,QIfa Zhang.et al.(2011)Natural variation in GS5plays an important role in regulating grain size and yield in rice.Nature Gennetics)研究发现GS5编码一个调节籽粒大小的丝氨酸羧肽酶,是控制籽粒大小的正调节因子,过表达GS5可使水稻籽粒明显变大;转录因子在调控籽粒大小方面起着非常重要的作用,OsWRKY78可以调节水稻茎的伸长和种子的发育,OsWRKY78突变体可使茎杆变矮化影响籽粒发育;螺旋-环-螺旋蛋白(bHLH)类转录因子能通过调控外稃和内稃细胞的长度影响谷粒的大小;PGL1碱性螺旋-环-螺旋蛋白(bHLH)异源二聚体作为结合DNA的bHLH的抑制子过表达后可增加籽粒长度和重量。
Homeoboxes(同源结构域蛋白)HB家族转录因子首次在果蝇、拟南芥中被发现。HB家族有300多个成员,参与了生物的生长发育多个方面。从结构上分析,Homeoboxes拥有DNA识别位点,包括TATA等一系列和DNA结合的结构域。目前HB家族转录因子Os03g55990对种子大小形状调控机制的研究及认识很少,因此该转录因子的研究在理论上为进一步理解植物种子和器官发育调控的分子机理提供了新的线索,在实践上也将为作物高产育种提供理论基础。
发明内容
本发明的目的是提供水稻转录因子Os03g55990基因CDS序列的应用。
为了实现本发明目的,本发明首先提供一种组成型水稻转录因子,即融合蛋白(VP16)4-Linker-Os03g55990。
其中,VP16为来自单纯疱疹病毒的VP16蛋白,将4个VP16功能域基序融合在一起可构成一类增强子,增强转录因子的功能,从而在转基因植株中出现更明显的表型变化。上述融合蛋白中涉及的(VP16)4,即VP64是由4个VP16蛋白的氨基酸序列以Gly-Ser为间隔形成的融合蛋白,其氨基酸序列和核苷酸序列分别如SEQ ID No.10和4所示。
上述融合蛋白中涉及的Linker由39个柔性氨基酸串联而成,其氨基酸序列如SEQ ID No.9所示,编码该Linker的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
上述融合蛋白中涉及的Os03g55990为水稻转录因子Os03g55990,其氨基酸序列如SEQ ID No.2所示,或该序列经替换、缺失或添加一个或几个氨基酸形成的具有同等功能的氨基酸序列,其CDS序列如Seq ID No.1所示。
本发明还提供编码所述组成型水稻转录因子的基因,以及在严格条件下,可与该基因的核苷酸序列发生杂交的核苷酸序列。所述严格条件为在含0.1%SDS的0.1×SSPE或含0.1%SDS的0.1×SSC溶液中,在65℃下杂交,并用该溶液洗膜。
本发明还提供含有编码所述组成型水稻转录因子的基因的载体、工程菌及细胞系。
所述载体的构建方法如下:
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