[发明专利]番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测方法、引物组及其应用有效
申请号: | 201310351007.3 | 申请日: | 2013-08-13 |
公开(公告)号: | CN103436636A | 公开(公告)日: | 2013-12-11 |
发明(设计)人: | 李战彪;秦碧霞;蔡健和;徐鹏超;韦学平;周文亮;林北森 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广西南宁公平专利事务所有限责任公司 45104 | 代理人: | 杨立华 |
地址: | 530007 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 番茄 环纹 斑点 病毒 rt lamp 检测 方法 引物 及其 应用 | ||
1.番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测引物组,其特征在于包括外侧引物对F3和B3、内侧引物对FIP和BIP,它们分别具有序列表SEQ.ID.No.1至SEQ.ID.No.4的碱基序列。
2.一种番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于该试剂盒包括A试液,A试液为LAMP反应体系,含有RT-LAMP Mix(2×)、AMV-Bst混合液、RNase-Free Water、RT-LAMP检测引物组。
3.根据权利要求2所述的番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于该试剂盒每剂A试液含RT-LAMP Mix(2×)12.5μl、AMV-Bst混合液1.5μl、RNase-Free Water2.8μl、RT-LAMP检测引物组6.2μl,其中FIP和BIP引物各2.5μl,终浓度均为1μM;F3和B3引物各0.6μl,终浓度均为0.25μM;所述引物F3、B3、FIP和BIP分别具有序列表SEQ.ID.No.1至SEQ.ID.No.4的碱基序列。
4.根据权利要求3所述的番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于该试剂盒还包括B试液和C试液;B试液含番茄环纹斑点病毒RNA,作为阳性对照;C试液为去离子水,作为阴性对照。
5.一种番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测方法,其特征在于:利用RT-LAMP检测引物组,在60-63℃恒温反应条件下,进行环介导恒温扩增反应30-120min,扩增完成后80℃再反应10min,然后利用琼脂糖凝胶电泳或荧光染色,鉴定植株样品是否感染番茄环纹斑点病毒;所述RT-LAMP检测引物组包括外侧引物对F3和B3、内侧引物对FIP和BIP,它们分别具有序列表SEQ.ID.No.1至SEQ.ID.No.4的碱基序列。
6.根据权利要求4所述的番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测方法,其特征在于:所述外侧引物对与内侧引物对的浓度比例为1:4。
7.根据权利要求5所述的番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测方法,其特征在于:所述外侧引物对与内侧引物对的浓度分别为0.25μM和1μM。
8.根据权利要求4所述番茄环纹斑点病毒RT-LAMP检测方法在烟草、辣椒、番茄或杂草上的应用。
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