[发明专利]一种结核分枝杆菌的耐药新基因及其应用有效
申请号: | 201310398783.9 | 申请日: | 2013-09-04 |
公开(公告)号: | CN104419710B | 公开(公告)日: | 2017-06-16 |
发明(设计)人: | 秦莲花;戈宝学;胡忠义;王洁;陆俊梅 | 申请(专利权)人: | 上海市肺科医院 |
主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C07K14/35;C07K16/12;C12N15/74;A61K39/04;A61P31/06 |
代理公司: | 上海申新律师事务所31272 | 代理人: | 竺路玲 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 结核 分枝杆菌 耐药 基因 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及一种基因片段,尤其涉及一种结核分枝杆菌的耐药新基因。
背景技术
结核病是一种严重危害人民健康的慢性传染病,其中,结核分枝杆菌(M.tuberculosis,俗称结核分枝杆菌),是引起结核病的病原菌。结核分枝杆菌可侵犯全身各器官,但以肺结核为最多见,我国是全球22个结核病流行严重的国家之一。虽然,随着生活水平提高和卫生状态改善,特别是开展了群防群治,儿童普遍接种卡介苗,使得结核病的发病率和死亡率大为降低。但是耐药及耐多药结核分枝杆菌的出现使得结核病的形势日益严峻,近年来世界各地结核分枝杆菌的多耐菌株逐渐增多,甚至引起暴发流行,我国第四次结核病流行病学抽样调查显示,我国结核病总耐药率以接近30%。
结核分枝杆菌的耐药可由自发突变产生(原发性耐药)或由用药不当经突变选择产生(继发性耐药),但多耐的产生可能主要是由于后者。随着耐药性研究的深入,人们发现结核分枝杆菌耐药性的产生大多是由于特定基因位点发生突变所致,目前已发现的耐药基因包括KatG、inhA、kasA、ndh、oxyR-ahpC基因间隔区、rpoB、embB、embC、embA、pncA、rrs、gyrA和gyrB基因等,例如结核分枝杆菌耐异烟肼的产生与过氧化氢酶-过氧化物酶编码基因KatG基因的缺失和突变有关,并与inhA基因的突变也有相关性;耐乙胺丁醇的产生和EMB基因的突变有关;耐链霉素的产生则是由于其核糖体蛋白S12编码基因rpsL和16SrRNA编码的rrs的缺失和突变所致;耐利福平的产生与其核心区域rpoB基因突变有关。因此,对结核分枝杆菌耐药基因及其编码蛋白的研究有助于进一步加强对结核分枝杆菌的治疗和预防。
尽管针对单一抗结核药物的耐药基因已多有揭示,但已知的耐药基因仅能解释部分临床菌株的耐药情况,并不能解释全部的耐药,尤其是临床菌株的耐多药情况。目前耐药结核分枝杆菌、尤其是耐多药结核分枝杆菌的传播和蔓延依然是结核病控制的难题,
因此,及时发现细菌中出现的耐药新基因,尤其是那些与细菌的耐多药产生相关的基因,对新的抗结核药物的开发及结核病的防治具有重要的意义。
发明内容
基于以上背景,本发明提供了一种新的结核分枝杆菌的耐药新基因,以及由所述基因编码的蛋白,以及它们的应用。
本发明第一个方面是提供一种结核分枝杆菌的耐药新基因,所述基因编码如下任意一种蛋白序列:
i)所述蛋白序列包含氨基酸和/或核苷酸序列表中的SEQ ID No.2序列;
ii)序列i)经过取代、缺失或叠加一个或几个氨基酸衍生的蛋白序列、并且能够使结核分枝杆菌产生耐药的蛋白序列。
在本发明第一个方面所述的耐药新基因中,所述蛋白序列优选为序列i)。
在本发明第一个方面所述的耐药新基因中,所述基因的编码区核苷酸序列包含氨基酸和/或核苷酸序列表中的SEQ ID No.1序列。
本发明第二个方面是提供一种蛋白序列,所述蛋白序列选自如下任意一种蛋白序列:
i)所述蛋白序列包含氨基酸和/或核苷酸序列表中的SEQ ID No.2序列;
ii)序列i)经过取代、缺失或叠加一个或几个氨基酸衍生的蛋白序列、并且具有与序列i)相同的功能。
在本发明第二个方面所述的耐药新基因中,所述蛋白序列优选为序列i)。
本发明第三个方面是提供一种重组载体,所述载体含有本发明第一个方面所述的任意一种耐药新基因。
本发明第四个方面是提供一种转化体,所述转化体含有本发明第一个方面所述的任意一种耐药新基因,或者本发明第三个方面所述的重组载体。
优选地,所述转化体为耐药菌株。
本发明第五个方面是提供一种制备上述转化体的方法,步骤包括:将本发明第一个方面所述的耐药新基因导入到宿主中。
本发明第六个方面是提供一种针对上述任意蛋白序列制备的工程抗体,其中,所述工程抗体能够免疫检测所述结核分枝杆菌、和/或免疫治疗所述结核分枝杆菌导致的感染疾病。
本发明第七个方面是提供一种上述任意一种转化体在制备预防结核分枝杆菌的免疫制剂中的应用。
本领域技术人员应当理解的是,本发明所述免疫制剂可以是由细菌制成的菌苗,以及由病毒、立克次体、螺旋体制成的为疫苗等。
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