[发明专利]GATA4基因SNP位点的用途无效
申请号: | 201310398808.5 | 申请日: | 2013-09-05 |
公开(公告)号: | CN103667440A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 谢小冬;苏刚;李培强;吴骅;李炯;李静 | 申请(专利权)人: | 谢小冬 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 730020 甘肃省兰州东岗西路*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | gata4 基因 snp 用途 | ||
技术领域
本发明属于生物医药技术领域,具体涉及GATA4基因SNP位点的用途及相关试剂盒。
背景技术
先天性心脏病(CHDs)是指在胎儿期心脏和(或)胸内大血管就存在严重的结构异常,从而导致一系列血流动力学障碍或功能性障碍的一种出生缺陷性疾病,它是造成发展中国家儿童死亡最常见的原因之一,其国内患病率为0.13%-1.38%,国外统计为0.4%-5%。先天性心脏病有很多类型,包括室间隔缺损(Ventricular septal defect,VSD)、房间隔缺损(Atrial septal defect,ASD)、动脉导管未闭(Patent ductus afteriosus,PDA)、肺动脉瓣狭窄(Pulmonary stenosis,PS)、主动脉缩窄(Coarctation of aortic,CoA)、大动脉转位(Transposition of the great arteries,TGA)、法洛四联症(Tetralogy of Fallot,TOF)、右室双出口(Double—outlet right ventricle,DORV)等。其中室间隔缺损居先天性心脏缺损首位。
室间隔缺损最早是Dalrymple在1847年报道的,它指心室的间隔部分因组织缺损形成异常开口而引起心室间异常血流交通,从而造成血液自左向右分流,导致血流动力学异常的一种先天性心脏缺损。正常情况下,右房收集来自全身各部位的氧含量较低的静脉血(缺氧血),流经右室然后泵入肺中进行气体交换。经过肺换气后,来自肺脏中的氧含量较高的动脉血(充氧血)流入左房,再流经左室,然后通过大动脉被泵入到身体的其他区域,以供给身体各部位的正常活动。当出现室间隔缺损时,由于左室的压力高,左室内的充氧血就会通过间隔上的异常开口而进入右室,这就导致额外的血液通过右室泵入肺中,从而造成肺充血。
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指存在于某一(些)群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异,并且在人群中的分布频率至少要在1%以上(Brookes AJ.Gene,1999,234(2):177—186),人类遗传基因的多态性在遗传信息上的本质表现,90%以上是由SNP所引起的。因为其多态信息量大,目前已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志。
从基础医学到临床医学的各个领域,SNP都存在巨大的应用价值。SNP的研究为基因诊断,尤其是疾病的早期诊断提供更多依据有重要意义。SNP由于其分布广、密度高而被期望在诸如癌症、糖尿病、高血压、忧郁症和哮喘等复杂疾病的研究中起重要作用,这些复杂疾病是多个遗传变异位点与环境因子共同作用的结果,由于发病原因复杂,涉及的基因数量多,已成为国际上疾病基因组学研究的重点。目前已有实验将SNP应用于肿瘤预后及易感性的判断,例如肺癌致癌物的易感性存在个体差异,即肺癌的基因易感性,研究较多的是代谢酶基因多态性,如人细胞色素P450-CYP450和髓过氧化酶MPO等。法国研究者证实,MPO基因启 动子(463G/A)多态性导致该基因较低的表达,可以降低肺癌患病的危险性(ChewierI,Stucker l,Houllier AM,et a1.pharmacogenetics,2003,13(2):729-739)。日本学者发现了HER-2基因编码区的一个SNP与胃癌的发展及恶性程度有关(Kuraoka K,Matsumura S,Hamai Y,et a1.Iht J Cancer,2003,107(4):593-596)。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是为胎儿先心病室间隔缺损易感性的早期诊断提供一种检测方法及相关试剂盒。
下述应用都是本发明所要保护的内容:
1、GATA4基因SNP位点rs867858和/或rs904018在制备先天性心脏病易感性的诊断试剂盒中的应用。其中,GATA4基因SNP位点rs867858的基因型为T/G时,先天性心脏病易感性增加;GATA4基因SNP位点rs904018的基因型为G/G时,先天性心脏病易感性降低。
2、GATA4基因SNP位点单倍型在制备先天性心脏病易感性的诊断试剂盒中的应用。其中,单倍型为rs8678586/rs904018G时,先天性心脏病易感性降低。
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