[发明专利]聋病易感基因SLC26A4 2168A>G、IVS7-2A>G突变检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201310410838.3 申请日: 2013-09-11
公开(公告)号: CN103451301A 公开(公告)日: 2013-12-18
发明(设计)人: 步迅;夏子芳;刘艳艳;张全芳;韩逸;张懿;谢建珍 申请(专利权)人: 步迅;夏子芳
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 250100 山东省济南市历城区*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 聋病易感 基因 slc26a4 2168 ivs7 突变 检测 试剂盒
【权利要求书】:

1.聋病易感基因SLC26A42168A>G、IVS7-2A>G突变检测试剂盒,其特征在于包括扩增试剂和一系列标准品;所述扩增试剂包括:PCR缓冲液、MgCl2和dNTPs的反应混合物,Taq酶,超纯水,高特异性扩增SLC26A4:2168A>G、IVS7-2A>G引物混合物,对上述位点进行特异性检测的探针混合物,对人基因组DNA进行检测的通用探针混合物,内对照及对内对照进行检测的引物探针混合物;所述一系列标准品包括:2168A>G分型标准品、IVS7-2A>G分型标准品。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:

用于SLC26A4:IVS7-2A>G检测的引物为:

SEQ NO.1:5’-TGGGATGGATTTAACAATGCC-3’

SEQ NO.2:5’-GTTAGAAAGTTCAGCATTATTTGGTTG-3’;

用于SLC26A4:2168A>G检测的引物为:

SEQ NO.3:5’-AATGGAACCTTGACCCTCTTGA-3’

SEQ NO.4:5’-TGTGATAGAAAAGCTGGAGCAATG-3’;

用于SLC26A4:IVS7-2A>G突变检测的探针为:

SEQ NO.5:5’-AAATGGCAGTAGCAATTATCGTCCGA-3’

用于SLC26A4:2168A>G突变检测的探针为:

SEQ NO.6:5’-CTTGGTTCTGTAGATAGAGTATAGCATCACGGC-3’;

用于对人基因组DNA进行检测的通用探针为:

SEQ NO.7:5’-GAATGTGTCCTTTCTAATGTTGTCGTC-3’;

其中LNA核苷以黑体字表示。

3.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述的内对照为一段人工合成的序列装载到pMD18-T的质粒载体上得到,这段人工合成的序列(SEQ NO.4)经过NCBI网站Blast没有找到高相关的同源区。扩增序列及对内对照进行检测的引物探针为:

SEQ NO.8:CACCAGCATCTCCCTTCATGTTGACTACCGTAGGCTGCCACCATTTCAGAAGAACGATGACCCCTTGCTAGCAGTGGAAGAGTTGCATGAAGGTAATATACTCGATCCGTAATTCCACTATTGAAATGGGTACATGACTGATACAGACCATC

SEQ NO.9:5’-CACCAGCATCTCCCTTCATGT-3’

SEQ NO.10:5’-GATGGTCTGTATCAGTCATGTACCCA-3’

SEQ NO.11:5’-GAACGATGACCCCTTGCTAGCAGTGGAAGAG-3’

4.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述的用于SLC26A4:2168A>G、IVS7-2A>G突变检测的探针,对人基因组DNA进行检测的通用探针,内对照探针,每条探针的5’端和3’端均进行荧光染料标记,5’端为发光基团和3’端为淬灭基团。

5.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于:所述用于对SLC26A4:2168A>G、IVS7-2A>G突变进行特异性检测的探针,对人基因组DNA进行检测的通用探针被分为四组,分别采用四种不同的发光基团对各组探针的5’端进行标记,3’端的淬灭基团可以为相同或不同的荧光染料。

6.根据权利4要求所述的试剂盒,其特征在于:探针所分为的四组为:用于对SLC26A4:IVS7-2A>G突变进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团;用于对2168A>G突变进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团;对人基因组DNA进行检测的通用探针采用同一组发光-淬灭基团;用于对内对照进行特异性检测的探针采用同一组发光-淬灭基团。

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