[发明专利]SNP标记及其应用有效
申请号: | 201310411234.0 | 申请日: | 2013-09-10 |
公开(公告)号: | CN104419706A | 公开(公告)日: | 2015-03-18 |
发明(设计)人: | 游欣欣;石琼;张勇;杨成业;阮志强;束礼平;蒙子宁;张海发;林浩然 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因研究院;深圳华大水产科技有限公司;中山大学;广东省大亚湾水产试验中心 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | snp 标记 及其 应用 | ||
1.一种斜带石斑鱼体重性状相关的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列自5’端起第381位碱基T或C。
2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记的TT基因型个体的体重显著高于CC和TC基因型个体。
3.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP标记的引物对,其特征在于,所述引物对具有SEQ ID NO:2-3所示的核苷酸序列。
4.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP标记的试剂盒,其特征在于,包含:
权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1或2所述的SNP标记、权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒,在斜带石斑鱼选育中的用途。
6.一种检测斜带石斑鱼体重性状的方法,其特征在于,通过对待测斜带石斑鱼进行权利要求1或2所述的SNP标记的检测,确定所述待测斜带石斑鱼的体重性状。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,通过对待测斜带石斑鱼进行权利要求1或2所述的SNP标记的检测,确定所述待测斜带石斑鱼的体重性状,进一步包括:
提取待测斜带石斑鱼的基因组DNA;
利用权利要求3所述的引物对,将所述待测斜带石斑鱼的基因组DNA进行PCR扩增,以便获得PCR扩增产物;
对所述PCR扩增产物进行测序,以便获得测序结果;
基于所述测序结果,确定所述待测斜带石斑鱼的所述SNP标记的基因型;以及
基于所述待测斜带石斑鱼的所述SNP标记的基因型,确定所述待测斜带石斑鱼的体重性状。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述SNP标记的TT基因型个体的体重显著高于CC和TC基因型个体。
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