[发明专利]COL4A5基因突变体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及COL4A5基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及分离编码COL4A5突变体的核酸，分离的多肽，筛选易患AS综合征的生物样品的方法，筛选易患AS综合征的生物样品的系统，用于筛选易患AS综合征的生物样品的试剂盒，构建体以及重组细胞。

背景技术

遗传性肾炎（即Alport综合征，在本文中有时也称为“AS综合征”）是一种主要表现为血尿、肾功能进行性减退、感音神经性耳聋和眼部异常的遗传性肾小球基底膜疾病。AS是一种单病，存在遗传异质性，现在认为共有3种遗传方式，即性连锁显性遗传、常染色体显性遗传及常染色体隐性遗传。性连锁显性遗传(OMIM：301050)为本病主要遗传方式，约占85%，致病基因为COL4A5，基因突变的发生率约为1/10000～1/5000。而1/7～1/3家系按常染色体显性遗传(MIM：203780)方式遗传，致病基因为COL4A3及COL4A4。常染色体隐性遗传方式(MIM：104200)并不多见，致病基因为常染色体基因COL4A3，因而一般近亲结婚才有发病的可能。本类疾病的致病相关机制已有较多报道，但目前仍不明确。

因而，目前对AS综合征的研究尤其是其致病突变的确定仍有待深入。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易患AS综合征的生物样品的方法。

本发明是基于发明人的下列工作完成的：发明人通过目标区域捕获联合候选基因突变验证的方法确定了AS综合征的一个新的致病突变——COL4A5基因的c.1365_1373delTCCAGGCCC突变。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的编码COL4A5突变体的核酸。根据本发明的实施例，所述核酸与SEQ ID NO：1相比，具有c.1365_1373delTCCAGGCCC突变，即相对于野生型COL4A5基因，本发明的COL4A5基因突变体的cDNA缺失第1365位到第1373位碱基TCCAGGCCC。根据本发明的实施例，发明人确定了COL4A5基因的突变体，该突变体与AS综合征的发病密切相关，从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易患AS综合征。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例，与SEQ ID NO：2相比，所述分离的多肽具有p.456_458delPGP突变，即该突变是由于c.1365_1373delTCCAGGCCC突变而引起的，具体地，相对于野生型COL4A5，本发明的分离的多肽（即COL4A5突变体）缺失第456位至第458位氨基酸PGP。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易患AS综合征。

根据本发明的第三方面，本发明提出了一种筛选易患AS综合征的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该方法包括以下步骤：从所述生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，具有c.1365_1373delTCCAGGCCC突变是所述生物样品易患AS综合征的指示。通过根据本发明实施例的筛选易患AS综合征的生物样品的方法，可以有效地筛选易患AS综合征的生物样品。

根据本发明的第四方面，本发明提出了一种筛选易患AS综合征的生物样品的系统。根据本发明的实施例，该系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，是否具有c.1365_1373delTCCAGGCCC突变，判断所述生物样品是否易患AS综合征。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易患AS综合征的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易患AS综合征的生物样品。

根据本发明的第五方面，本发明提出了一种用于筛选易患AS综合征的生物样品的试剂盒。根据本发明的实施例，该试剂盒含有：适于检测COL4A5基因突变体的试剂，其中与SEQ ID NO：1相比，该COL4A5基因突变体具有c.1365_1373delTCCAGGCCC突变。利用根据本发明的实施例的试剂盒，能够有效地筛选易患AS综合征的生物样品。