[发明专利]艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因Bb-KS、其编码蛋白质以及基因克隆方法有效
申请号: | 201310456535.5 | 申请日: | 2013-09-30 |
公开(公告)号: | CN103525848A | 公开(公告)日: | 2014-01-22 |
发明(设计)人: | 官玲亮;庞玉新;胡雄飞;吴丽芬;于福来;张影波;王丹;韦睿斌;陈振夏 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;庞玉新 |
主分类号: | C12N15/60 | 分类号: | C12N15/60;C12N9/88;C12N15/10 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 艾纳香内根 贝壳 杉烯合酶 基因 bb ks 编码 蛋白质 以及 克隆 方法 | ||
技术领域
本发明涉及基因及其克隆方法,同时也涉及到基因编码蛋白质,属于生物技术领域,具体涉及一种艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因Bb-KS、其编码蛋白质以及基因克隆方法。
背景技术
艾纳香(Blumea balsamifera L.DC.)为菊科艾纳香属多年生木质草本植物,主要分布于我国海南、贵州、广西、广东、云南、台湾等省。以其全草或地上部分入药,具有镇痛、发汗、祛风除湿、去痰止咳、通经止血等功效,在黎族、苗族、壮族等少数民族地区有着悠久的用药历史,是一种重要的民间药物。同时艾纳香也是获取天然冰片(艾片)的重要植物来源之一。并且,在精制艾片过程中所产生的艾油具有扩张血管、降低血压、抑制交感神经的作用,因而被广泛应用于医药行业。另外,艾油因其独特的芳香气味,还被广泛应用于香料以及化妆品行业。虽然以艾纳香为原材料的产品众多,然而关于其化学成分的研究较少。
对于艾纳香而言,其化学成分比较复杂,但具有药理作用的主要集中在黄酮类和挥发油成分上。邓芹英等(1996),曹家庆等(2008),陈铭等(2009)分别对艾纳香中黄酮类成分进行了分析,主要含有艾纳香素、木犀草素、槲皮素、儿茶素以及阿亚黄素等。关于艾纳香挥发油成分的研究:周欣等(2001)、马芝玉等(2009)采用GC/MS方法检测到艾纳香中挥发油成分主要为:L-龙脑、樟脑、β-石竹烯、芳樟醇、大叶香烯D、香木兰烯、顺-α-没药烯、β-荜澄茄油烯、γ-依兰 油烯、ent-贝壳杉烯等萜类化合物。除此之外,艾纳香中还含有多其他种化合物,如小麦黄素、芹菜素、原儿茶酸(甲酯)、咖啡酸(甲酯)、香草酸等化合物。其中,ent-贝壳杉烯类二萜化合物具有广泛的生理活性,主要表现为抗肿瘤活性。由于ent-贝壳杉烯类化合物主要来自于天然产物,化合物供应量非常有限。
内根-贝壳杉烯合酶(KS)是贝壳杉烯类化合物合成过程中的关键酶之一,也是合成赤霉素等信号分子的关键酶,对植物的生长发育起着至关重要的作用。目前在研究植物生长发育及抗性中涉及较多研究,而从植物次生代谢及产物药理药效活性方面研究较少。KS过去被称为内根-贝壳杉烯合酶B,位于前质体,具有引导序列,与古巴焦磷酸合酶(Copalyl pyrophosphate synthase,CPS)共同催化牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸(GGPP)形成内根-贝壳杉烯(ent-kaurene)。KS最早是从南瓜未成熟的种子中得到的,其突变严重影响植株的发育。拟南芥中的GA2蛋白编码KS基因,在拟南芥的研究中发现,ga2矮化突变体是由KS基因的功能缺失造成的,对突变体ga2-1的序列进行分析,发现其cDNA中单碱基发生突变导致终止密码子提前出现,从而使得KS基因失活。目前,KS基因在拟南芥、蓖麻、甜叶菊、梨、苹果等植物上成功克隆,但目前还没有关于艾纳香内根-贝壳杉烯合酶(KS)基因的相关报道。因此,对艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因的克隆以及对他们的生物学功能研究,将有助于明确艾纳香中二萜类次生代谢的分子机理,为调控其艾纳香中有效成分等奠定基础。
发明内容
鉴于上述问题,本发明的主要目的在于提供一种首次从艾纳香种获得的内根-贝壳杉烯合酶基因。
本发明的另一个目的是提供艾纳香内根-贝壳杉烯合酶编码的氨基酸序列及编码蛋白质性质生物信息学预测。
同时,本发明还提供该艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因的克隆方法。
为了达到上述目的,本发明提供:
本发明所提供的艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因,从艾纳香(Blumea balsamifera DC)中克隆,命名为Bb-KS基因,核苷酸序列如SEQ ID NO:1。
上述艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因编码的蛋白质,命名为Bb-KS蛋白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO:2。
一种艾纳香内根-贝壳杉烯合酶基因Bb-KS的克隆方法,包括如下步骤:
(1)选用艾纳香叶片作为试验材料,采用TRNzol法提取总RNA;
(2)采用TaKaRa公司生产的PrimeScriptTM 1st Strand cDNA Synthesis Kit进行反转录获得cDNA;
(3)根据NCBI上其他植物KS基因保守区域,设计兼并引物PF1:TGGTCR(A/G)TTTGATCR(A/G)TATK(T/G)CAATC和
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