[发明专利]侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法

权利要求书

1.一种侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法，该方法包含：

提供一受测检体；

检测该受测检体的基因组DNA中至少一个目标基因的CpG序列甲基化状态，该目标基因选自由ZNF671、PTPRR、SOX1、PAX1、ZNF582、AJAP1、SOX17、EDN3、ST6GAL2、ZNF614、PTGDR、SYT9、SOX8、HS3ST2、POU4F3、ADRA1D、MAGI2、EPO、NEFH、POU4F2、STC2以及THRB所组成的群组至少一个；以及

根据该目标基因甲基化状态的有无，判断该检体是否具有癌症或癌前病变，或作为治疗预后的指标。

2.如权利要求1所述的侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法，其特征在于：其中该目标基因为ZNF671与另一目标基因选自由PTPRR、SOX1、PAX1、ZNF582、AJAP1、SOX17、EDN3、ST6GAL2、ZNF614、PTGDR、SYT9、SOX8、HS3ST2、POU4F3、ADRA1D、MAGI2、EPO、NEFH、POU4F2、STC2以及THRB所组成的群组至少一个。

3.如权利要求1所述的侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法，其特征在于：其中该受测检体包含尿液、粪便、血液、腹水、痰、口腔黏膜细胞、胃液、胆汁、或手术后的膀胱癌组织离体样本。

4.如权利要求1所述的侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法，其特征在于：其中该目标基因的CpG序列甲基化状态检测方法包含甲基化特异性聚合酶连锁反应(methylation-specific PCR，MSP)、定量甲基化特异性聚合酶连锁反应(quantitative methylation-specific PCR，QMSP)、亚硫酸盐定序(bisulfite sequencing，BS)、微数组(microarrays)、质谱仪分析(mass spectrometer)、变性高效液相色谱(denaturing high-performance liquid chromatography，DHPLC)、及焦磷酸定序(pyrosequencing)中至少一者。

5.如权利要求1或2所述的侦测膀胱癌的新颖表基因生物标记及其方法，其特征在于：其中该目标基因甲基化的状态由引子对序列所侦测，各个目标基因的引子对分别为：ZNF671引子对为SEQ ID No：1-2、PTPRR引子对为SEQ ID No：3-4、SOX1引子对为SEQ ID No：5-6、PAX1引子对为SEQ ID No：7-8、ZNF582引子对为SEQ ID No：9-10、AJAP1引子对为SEQ ID No：11-12、SOX17引子对为SEQ ID No：13-14、EDN3引子对为SEQ ID No：15-16、ST6GAL2引子对为SEQ ID No：17-18、ZNF614引子对为SEQ ID No：19-20、PTGDR引子对为SEQ ID No：21-22、SYT9引子对为SEQ ID No：23-24、SOX8引子对为SEQ ID No：25-26、HS3ST2引子对为SEQ ID No：27-28、POU4F3引子对为SEQ ID No：29-30、ADRA1D引子对为SEQ ID No：31-32、MAGI2引子对为SEQ ID No：33-34、EPO引子对为SEQ ID No：35-36、NEFH引子对为SEQ ID No：37-38、POU4F2引子对为SEQ ID No：39-40、STC2引子对为SEQ ID No：41-42、THRB引子对为SEQ ID No：43-44；其中该引子包含至少有50%的序列同一性、互补性或至少连续十个核苷酸相同的序列。