[发明专利]一种生命科学应用的集群分配方法、软件安装方法及装置

权利要求书

1.一种生命科学应用的集群分配方法，包括：

对生命科学应用进行分类；

根据各类应用对集群资源的需求，为各类应用分配满足分配策略的集群。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于：

所述对生命科学应用进行分类包括：

将所述生命科学应用分为：序列比对、序列拼接、分子动力学、分子对接、蛋白质结构预测、质谱解析和三维电镜重构。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于：所述对集群资源的需求包括：对内存容量需求、对磁盘IO需求、主频敏感度和扩展性的要求；

所述分配策略包括：

当某类应用对内存容量需求及磁盘IO需求大于第一阈值时，为该类应用分配胖节点集群；

当某类应用对内存需求小于第一阈值、对磁盘IO需求小于第一阈值且大于第二阈值、主频敏感度大于第三阈值、对网络带宽需求高于第四阈值且扩展性好时，为该类应用分配双路高主频、高网络带宽集群；

当某类应用对内存容量需求小于第一阈值、对磁盘IO需求大于第一阈值、主频敏感度大于第三阈值且扩展性好时，为该类应用分配双路高主频高IO吞吐集群。

4.一种生命科学应用的集群软件安装方法，包括：

对生命科学应用进行分类；

根据各类应用对集群资源的需求，为各类应用分配满足分配策略的集群；

在所述集群的节点上将待安装的应用软件使用静态库进行安装。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于：

在所述集群的节点上将待安装的应用软件使用静态库进行安装包括：

根据所述应用的类别将各个类别对应的应用软件使用静态库编译软件，生成二进制文件，并将每类应用的所述二进制文件构建一个文件夹。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于：所述方法还包括：

当有应用软件需要更新时，将需要更新的应用软件使用静态库重新编译软件生成二进制文件，添加到相应应用类别的所述文件夹中。

7.如权利要求4所述的方法，其特征在于：在所述集群的节点上将待安装的应用软件使用静态库进行安装之前，还包括：

在所述集群中的节点上安装操作系统及集群文件系统，安装编译器并设置消息传送接口MPI并行环境。

8.如权利要求4所述的方法，其特征在于：

所述对生命科学应用进行分类包括：

将所述生命科学应用分为：序列比对、序列拼接、分子动力学、分子对接、蛋白质结构预测、质谱解析和三维电镜重构。

9.如权利要求4所述的方法，其特征在于：所述对集群资源的需求包括：对内存容量需求、对磁盘IO需求、主频敏感度和扩展性的要求；

所述分配策略包括：

当某类应用对内存容量需求及磁盘IO需求大于第一阈值时，为该类应用分配胖节点集群；

当某类应用对内存需求小于第一阈值、对磁盘IO需求小于第一阈值且大于第二阈值、主频敏感度大于第三阈值、对网络带宽需求高于第四阈值且扩展性好时，为该类应用分配双路高主频、高网络带宽集群；

当某类应用对内存容量需求小于第一阈值、对磁盘IO需求大于第一阈值、主频敏感度大于第三阈值且扩展性好时，为该类应用分配双路高主频高IO吞吐集群。

10.一种生命科学应用的集群分配装置，包括：

分类模块，用于对生命科学应用进行分类；

集群分配模块，用于根据各类应用对集群资源的需求，为各类应用分配满足分配策略的集群。

11.如权利要求10所述的装置，其特征在于：

所述对生命科学应用进行分类包括：

将所述生命科学应用分为：序列比对、序列拼接、分子动力学、分子对接、蛋白质结构预测、质谱解析和三维电镜重构。