[发明专利]ABCA3基因在制备先天性CCMC诊断制品中的应用有效
申请号: | 201310468448.1 | 申请日: | 2013-10-09 |
公开(公告)号: | CN103589787A | 公开(公告)日: | 2014-02-19 |
发明(设计)人: | 陈鹏;代云海;谢立信;王晔;肖晶晶;张清岩;管李萍;王俊 | 申请(专利权)人: | 山东省眼科研究所;深圳华大基因研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | abca3 基因 制备 先天性 ccmc 诊断 制品 中的 应用 | ||
技术领域
本发明属于基因诊断与产前基因诊断的相关技术领域,具体涉及ATP连接盒(ABC)转运子A3(ABCA3)在制备检测先天性白内障-小角膜综合征(CCMC)基因诊断制品中的应用。
发明背景
先天性白内障是导致儿童低视力和致盲的常见眼病,发病率约为0.01%~0.06%,其中约50%与遗传有关,其遗传方式以常染色体显性遗传最为常见。先天性白内障可独立发生,也可作为眼部或全身综合征的伴发症状,其中12%-18%的先天性白内障患者常发生合并小角膜症状。白内障-小角膜综合征(Cataract-microcornea syndrome,CCMC,OMIM116200)是一种先天发育异常性眼病,常累及双眼,表现为不同表型的白内障及角膜横径小于10mm,常伴发眼前节发育不良,如虹膜缺损、Peters异常、瞳孔异位及眼球震颤等,这些多发畸形常使大多数患者丧失视力,是先天性致盲的重要原因之一。并且和单纯先天性白内障相比,伴发小角膜的患者更易患青光眼,并造成不可逆转的视觉损害。目前对于CCMC治疗手段有限、致盲率很高,给全社会带来沉重的经济负担。
先天性CCMC的病因及病理机制尚不清楚,目前世界上研究较少。国内外的遗传学研究结果表明该病很大程度上是由于遗传因素导致的。迄今为止,已有7个致病基因被证实(详见表1)。
表1:白内障-小角膜综合征致病基因定位及克隆情况
CCMC具有显著的遗传异质性,存在多个候选致病基因。到目前为止对CCMC的致病基因的了解仍然有限,迄今为止7个已知基因仅能解释不到30%的患者的发病。这已经成为CCMC的发病机制的研究以及针对病因的诊断和治疗研究的瓶颈。这种现状促使进一步去发现和了解该病新的致病基因,为后续的基因诊断、产前诊断及基因治疗提供基础。
发明内容
本发明的目的是提供一种ABCA3基因在制备检测先天性白内障-小角膜综合征(CCMC)诊断制品中的应用,从而弥补现有技术的不足。
申请人发现了一个4代呈常染色体显性遗传的CCMC家系,经过候选基因测序,排除了已知的7个候选基因突变致病的可能;同时,进一步对该家系的核心成员进行了外显子组测序,找到了该家系的致病基因ATP连接盒(ABC)转运子A3(ABCA3),从而促成了本发明。
本发明首先提供ABCA3基因新的用途,是在制备用于检测先天性白内障-小角膜综合征(CCMC)诊断制品中的应用;
本发明还提供一种用于检测先天性白内障-小角膜综合征(CCMC)的引物对,所述的引物对的上下游引物序列为SEQ ID NO:1-38,其引物信息如下:
ABCA3-1L:AGAAATGGAAAGTGACTCCTCT SEQ ID NO:1
ABCA3-1R:GTCTGTGGGTTACTGGAAGTT SEQ ID NO:2
ABCA3-2L:AACTTCCAGTAACCCACAGAC SEQ ID NO:3
ABCA3-2R:AGAGTGGAGTCAGAATCAAGGT SEQ ID NO:4
ABCA3-3L:ACCTTGATTCTGACTCCACTCT SEQ ID NO:5
ABCA3-3R:GAAAGAGTCCTAGCACATCAGA SEQ ID NO:6
ABCA3-4L:AGCTTTAGCTCATTACCTTGTC SEQ ID NO:7
ABCA3-4R:CCTGGTCAATCAGACAGAATTA SEQ ID NO:8
ABCA3-5L:ACATCAGAGCTGATTCTGTGAC SEQ ID NO:9
ABCA3-5R:ATAGTTTATGTCTCCTGGATGC SEQ ID NO:10
ABCA3-6L:CGTACAGTGGGAGACCATC SEQ ID NO:11
ABCA3-6R:CACTAATCCAGTGTCTCACCTT SEQ ID NO:12
ABCA3-7L:GCTGGGACACTCACTATATTTC SEQ ID NO:13
ABCA3-7R:CTGATGAACTTCTTCTTCTTGG SEQ ID NO:14
ABCA3-8L:GTTCTCGTAGAAACTGCTGACT SEQ ID NO:15
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