[发明专利]与棉花显性无腺体基因Gl2e紧密连锁的SSR标记及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及与棉花显性无腺体基因Gl₂^e紧密连锁的SSR标记及其应用。

背景技术

棉花是世界上最重要的经济作物之一，它给人类提供了天然纤维，同时其棉籽也是重要的蛋白和植物油资源。但是目前种植的棉花品种中都含有大量的色素腺体，其中所含有的萜类物质对人以及其他的单胃动物有毒害作用，这大大制约了棉籽蛋白和棉籽油的利用，因此，进行无腺体棉花的育种非常必要。

棉花腺体也叫棉酚腺体或棉花色素腺体，通常呈褐色或黑褐色点状，遍布于腺体棉植株除花粉、种皮以外的绝大多数部位和器官。早在20世纪的50年代，棉花育种家们就展开了棉花色素腺体基因进行研究的工作，相继发现了gl₁、gl₂、gl₃、gl₄、gl₅、gl₆这6个跟棉酚腺体相关的基因，进一步研究表明，整个植株不含棉酚腺体的性状是由两对相对独立的隐性重叠基因所控制，即gl₂gl₂gl₃gl₃。在相应的6个基因位点上也存在多个复等位基因，其中单显性基因Gl₂^e表型与双隐性基因gl₂gl₂gl₃gl₃表型相似。Gl₂^e首先是由埃及的Afifi等在海岛棉突变体“Bahtim110”中发现的，后美国学者Kohel用“Bahtim110”与陆地棉标准系“TM-1”杂交，将“Bahtim110”的显性无腺体基因替换到“TM-1”遗传背景中，结果表明，该性状受位于Gl₂位点上的显性突变基因所控制，可以显性抑制棉酚腺体的表型，定名为Gl₂^e（即显性无腺体基因），其为低酚棉育种提供了一个重要的基因资源。目前，Gl₂^e已被定位在棉花第12条染色体上，对Gl₂^e进行精细定位并进一步克隆对低酚棉育种和研究具有重要意义。

分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比，DNA分子标记具有的优越性有：大多数分子标记为共显性，对隐性的性状的选择十分便利；基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；在生物发育的不同阶段，不同组织的DNA都可用于标记分析；分子标记揭示来自DNA的变异；表现为中性，不影响目标性状的表达，与不良性状无连锁；检测手段简单、迅速。

发明内容

本发明的目的是提供一种与棉花显性无腺体基因Gl₂^e紧密连锁的SSR标记及其应用。

本发明所提供的SSR标记的名称为：BS4、BS5和BS6；扩增该SSR标记的相应的引物对名称为：引物对BS4、BS5和BS6。

本发明需要保护的是如下1）—7）中任一种引物对或引物对组：

1）引物对BS4、引物对BS5和引物对BS6；

2）引物对BS4和引物对BS5；

3)引物对BS4和引物对BS6；

4)引物对BS5和引物对BS6；

5）引物对BS4；

6）引物对BS5；

7)引物对BS6；

所述引物对BS4由序列表序列1所示的单链DNA和序列表序列2所示的单链DNA组成；

所述引物对BS5由序列表序列3所示的单链DNA和序列表序列4所示的单链DNA组成。

所述引物对BS6由序列表序列5所示的单链DNA和序列表序列6所示的单链DNA组成。

上述引物对或引物对组在棉花显性无腺体基因Gl₂^e的定位或克隆、棉花分子标记辅助育种中具有重要的应用价值。

利用本发明提供的引物对，可以进行鉴定或辅助鉴定无腺体棉花，该鉴定的方法包括：

用引物对BS4对待测棉花的基因组DNA进行PCR扩增，得到产物甲；

和/或，用引物对BS5对待测棉花的基因组DNA进行PCR扩增，得到产物乙；