[发明专利]多级PCR检测淋病奈瑟菌的方法和试剂盒有效
申请号: | 201310487967.2 | 申请日: | 2013-10-17 |
公开(公告)号: | CN103882101B | 公开(公告)日: | 2018-11-30 |
发明(设计)人: | 洪国藩 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/04;C12M1/34;C12R1/36 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 祝莲君;刘真真 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多级 pcr 检测 淋病 奈瑟菌 方法 试剂盒 | ||
1.一种非诊断且非治疗性的鉴别病原体种类或型别的方法,其特征在于,包括步骤:
(a)在封闭的第一级PCR反应腔或隔室中,以含有或可能含有病原体核酸的样本为模板,通过所述病原体特异性的第一引物对进行扩增,从而获得第一扩增产物P1;
(b)将第一扩增产物从第一级PCR隔室转移至第二级PCR隔室中,作为第二级PCR的模板,并在封闭的第二级PCR隔室中,通过所述病原体特异性的第二引物对进行扩增,从而获得第二扩增产物P2;
(c)任选地,将上一步骤的扩增产物Pi从第i级PCR隔室转移至第i+1级PCR隔室中,作为第i+1级PCR的模板,并在封闭的第i+1级PCR隔室中,通过所述病原体特异性的第i+1引物对进行扩增,从而获得第i+1扩增产物Pi+1,其中i为≥2的正整数;本步骤可进行一次或多次;
(d)对前述步骤中获得的所述第二扩增产物P2或所述第i+1扩增产物Pi+1,进行测序,从而获得扩增产物的序列;和
(e)将测得的扩增产物序列与病原体标准序列进行比对,从而鉴别出病原体的种类或型别;
并且,所述病原体为细菌;
且在步骤(a)中,第一级PCR隔室中放置有可携带PCR扩增产物的固体颗粒,从而在PCR反应过程中或之后,形成携带PCR扩增产物的固体颗粒;且所述的固体颗粒是磁性微球;且在步骤(b)和(c)中,利用磁铁或电磁铁,通过所述携带PCR扩增产物的固体颗粒,将第j扩增产物Pj从第j级PCR隔室转移至第j+1级PCR隔室,其中j为≥1的正整数;
其中,该过程在多级PCR反应管中进行,所述反应管由二个或多个可封闭的PCR反应腔或隔室(10),以及在至少两个隔室之间设有的封闭的或可封闭的连接通道(40)所组成,所述连接通道用于让携带PCR扩增产物的固体颗粒(50)从一个隔室或上游隔室转移至另一隔室或下游隔室;
且所述的隔室具有腔盖,并且对于相互连通的多个隔室而言,当各自的腔盖全部盖上后,就构成一个封闭空间,并且所述腔盖为密封盖;且在多级PCR反应开始至多级PCR反应结束期间,整个所述的多级PCR反应管处于完全封闭状态。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤(b)和(c)中,将第j扩增产物Pj从第j级PCR隔室转移至第j+1级PCR隔室过程中,第j级PCR隔室和第j+1级PCR隔室都处于封闭状态,其中j为≥1的正整数,并且在第j级PCR隔室和第j+1级PCR隔室之间设有封闭的或可封闭的连接通道,所述连接通道用于让携带PCR扩增产物的固体颗粒从Pj级隔室或上游隔室转移至Pj+1级隔室或下游隔室。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤(a)、(b)和(c)的整个过程中,所有的PCR隔室都处于封闭状态。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的病原体为奈瑟菌科(Neisseriaceae)细菌。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述的第一引物对为C trachomatis HiFi外侧引物对即HiFi DNA Tech No.4003。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的第二引物对为C trachomatis HiFi外侧引物对即HiFi DNA Tech No.4004;且当i=2时,第三引物对与第二引物对相同。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述病原体为奈瑟菌属(Neisseria)细菌。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述病原体为淋病奈瑟菌(N.gonorrhoeae)。
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