[发明专利]TERT启动子的单核苷酸多态性序列

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及TERT启动子的单核苷酸多态性序列。

-背景技术

膀胱癌是排在第九位的全球最常见的肿瘤。2013年,在美国有超过73000名患者被诊断为膀胱癌，其中死亡人数约15000人。其中超过90%的患者最初诊断为原发性膀胱癌，大约75%的患者目前为表浅膀胱肿瘤,20%的为浸润性膀胱肿瘤,剩下的5%初诊为转移性肿瘤。先前的研究表明,膀胱癌有着多变的临床表现和遗传背景。最近的膀胱肿瘤研究报道了8个相关基因(UTX,MLL-MLL3,CREBBP-EP300,NCOR1, ARID1A,CHD6)。

目前检测“膀胱癌”采用的肿瘤标记物主要有以下几种，但是各肿瘤标志物都存在不同的缺点：

(1)、膀胱肿瘤抗原(BTA)：BTA试剂分为BTA stat和BTA test两种；首先，这两种试剂都不能独立用于确诊膀胱癌；另外，BTA试剂价格昂贵，目前尚难以全面推广使用；

(2)、Lewis X抗原检测：Lewis X是一种ABO血型相关抗原，在正常尿路上皮中不存在该抗原；而5%～89%的移行细胞癌可检出Lewis X，但Lewis X与肿瘤的分级无关；

(3)、核基质蛋白22(nuclear matrix protein22，NMP22)：NMP22是核有丝分裂器蛋白，诊断膀胱癌的敏感性为48%～90%，特异性为70%～92%，NMP22对高级，高期膀胱癌敏感性较高；

(4)、纤维蛋白/纤维蛋白降解产物(fibrin degradation products，FDP)：用快速免疫检测法测定尿中FDP诊断膀胱癌的敏感性为68%，对T2～T4期膀胱癌的敏感性更是高达100%；

(5)、玻璃酸酶检测hyaluronidase,HAase：玻璃酸酶是一种细胞外降解基质透明质酸的内源性糖苷酶，在肿瘤进展中起重要作用，应用凝胶技术检测G2，G3级膀胱癌尿液中玻璃酸酶活性，敏感性达92%～100%；

(6)、端粒酶活性(telomerase)：端粒是位于染色体末端的保护性结构，随细胞分裂逐步缩短，直至细胞死亡，端粒酶的作用就是延长端粒，现已发现多种肿瘤细胞中端粒酶活性增强，该法诊断包括低级，低期肿瘤在内的膀胱癌，敏感性可达91%。

然而，导致膀胱肿瘤发生的关键点仍未完全阐明，同时由于这些个体标记的灵敏性较低以至于未被应用于临床实践中，这表明需要新的灵敏性高的生物标记。

发明内容

在本发明的试验过程中，在超过85%的人类肿瘤研究中发现端粒酶逆转录酶(TERT， TERT通过Human Genome Browser获取 NCBI发布版本37的人类基因组序列：Feb.2009(GRCh37/hg19 )；>hg19_ensGene_ENST00000310581_0 range=chr5:1295163-

1296562 5'pad=400 3'pad=0 strand=- repeatMasking=none)活跃,我们认为是一个人类肿瘤发生的重要机制。TERT是端粒酶的催化部分，位于5号染色体短臂 , 在人类肿瘤中调节端粒酶活性。最近人们应用全基因组测序在黑素瘤中发现TERT启动子突变。人们在一些膀胱癌样本中证实了高频率的TERT启动子突变。一些研究发现, 具有活性的端粒酶或TERT表达增加与肿瘤的病理分期以及临床分期是相关联的。然而,人们还未获得TERT基因拷贝，TERT的表达或活性对膀胱癌的临床影响仍然是有争议的。在本发明中，我们通过试验得到TERT启动子的高频突变位点，并进行了相关的体外功能分析试验来证实：这些启动子的突变可提高ETRT活性，是导致恶性肿瘤发生的关键点所在，这些突变对泌尿生殖系统恶性肿瘤的诊断和预后具有重要的意义。

本发明的目的在于公开了一种TERT启动子的单核苷酸多态性序列。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：

一种TERT启动子的单核苷酸多态性序列，其中，单核苷酸多态性序列为：

TERT启动子chr5,1,295,228位为C或T(即反链第chr5, 1,295,228位为G或A)的碱基多态性序列；

TERT启动子chr5,1,295,242-1,295,243位为CC或TT(即反链第chr5,1,295,242-1,295,243位为GG或AA)的碱基多态性序列；