[发明专利]SSR引物组及其利用该引物组鉴定辣椒品种的方法有效
申请号: | 201310516095.8 | 申请日: | 2013-10-28 |
公开(公告)号: | CN103525813A | 公开(公告)日: | 2014-01-22 |
发明(设计)人: | 何建文;苏丹;姜虹;韩世玉;刘永翔;刘作易 | 申请(专利权)人: | 贵州省辣椒研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
地址: | 550006 贵州*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ssr 引物 及其 利用 鉴定 辣椒 品种 方法 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物技术领域,具体来说是一种引物及其利用该引物鉴定辣椒品种的方法。
背景技术
品种鉴定是农业生产、作物育种和种子检验上的重要方法,也是保护作物品种、防止假冒伪劣品种进入市场的重要手段。传统的种子质量检验方法有田间性状鉴定和籽粒形态鉴定等,但是,田间性状鉴定所需周期长,耗费大量人力、物力和财力。辣椒种子质量监控是辣椒生产的重要环节。在辣椒生产中,地方品种混杂现象严重,常规鉴别耗时较长,田间鉴别难度较大,随着分子生物学技术的飞速发展,分子标记技术不断成熟,给作物从品种基因组水平上的鉴定开辟了途径。
发明内容
为实现上述辣椒品种鉴定中出现的问题,本发明的目的在于,提出辣椒品种鉴定的分子检测方法,该方法利用分子标记技术,在苗期实现辣椒品种鉴定,具有周期短,成本低,结果可靠,节约人力,物力及土地资源,大大提高了品种鉴定的准确性。
为了实现上述目的,本发明采用的技术方案是:一种SSR引物组,该SSR引物组序列如下:
本发明的另一目的是提供一种利用SSR引物组鉴定辣椒品种的方法,包括如下步骤:
(1)辣椒叶片DNA提取;
(2)PCR扩增;
(3)电泳检测;
(4)数据记录;
(5)结果判定。
进一步的,所述步骤(2)中PCR扩增程序为94℃预变性5min;94℃变性45s,60℃复性45s,72℃延伸1min,35个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。
进一步的,所述步骤(2)中PCR扩增体系包括包括20ng模板DNA,2.5mmol/L Mg2+,0.2mmol/L dNTPs,1U TaqDNA聚合酶,每条引物400nmol/L,10×Buffer。
进一步的,所述步骤(5)结果判定时,如果两个品种(品系或者自交系)在两个或两个以上SSR标记位点具有不同等位,则判定为不同品种。
本发明的有益技术效果是:本发明引物特异性高,扩增效率好,能快速鉴定辣椒的不同品种,具有周期短,成本低,结果可靠,节约人力、物力及土地资源特点。
附图说明
图1本发明方法检测H224、H137、H089、H204、H042023A、H009、H015、H004、H102、H042025D共10个自交系电泳结果图;
图2利用本发明检测香辣四号、元辣华帅、元辣红丰及曼迪金条电泳结果图。
具体实施方式
下面结合具体实施实例对本发明做进一步说明
实施实例1
(1)辣椒基因组DNA提取:选用H224、H137、H089、H204、H042023A、H009、H015、H004、H102、H042025D共10个本研究所自育自交系材料,待苗期采集植株新鲜幼嫩叶片2~3g,采用改进的CTAB方法提取DNA样品。具体步骤为:①用1.5ml离心管盖取幼苗叶片(约12~15mg),置于冰上;②加抽提液100μl,研磨成浆;③65℃水浴20-40min,其间颠倒离心管两次;④取出微离心管,放置5-10min,冷至室温;⑤加入100μl的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),上下颠倒混合5min,3200-12000rpm离心10min;⑥转移上清至另一1.5ml离心管,加入7.5μl5mol/L NaCl,用100μl无水乙醇(冰冻或室温)沉淀DNA;⑦短暂离心,除去乙醇,用75%乙醇洗涤,12000rpm离心5min,弃乙醇,自然干燥至没有乙醇气味;⑧加入200μl灭菌ddH2O或TE(pH=8.0),4℃保存待用。
(2)以提取的辣椒基因组DNA为模板,利用筛选出的20对SSR引物进行PCR扩增。
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