[发明专利]水仙BES-SSR标记引物TA34及鉴定水仙品种的方法有效
申请号: | 201310561494.6 | 申请日: | 2013-11-13 |
公开(公告)号: | CN103555851A | 公开(公告)日: | 2014-02-05 |
发明(设计)人: | 祁世明;潘东明;林琳;郭志雄;潘腾飞 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水仙 bes ssr 标记 引物 ta34 鉴定 品种 方法 | ||
1.一种水仙BES-SSR标记引物TA34,由上游引物TA34F和下游引物TA34R组成,其特征在于核苷酸序列如下:
TA34 F: 5'-GCTTTTCGCAAAAGATAGTGAG-3′
TA34 R: 5'-CGTGCCAAATAGTAAGGGGTC-3′。
2.利用如权利要求1所述的水仙BES-SSR标记引物TA34鉴定水仙品种的方法,包括水仙基因组总DNA提取、PCR总反应体系建立、PCR扩增程序、聚丙烯酰胺凝胶电泳条件和PCR扩增产物的检测鉴定,其特征在于:
(1)水仙基因组总DNA提取:利用改良的CTAB法提取水仙基因组总DNA;
(2)PCR总反应体系建立:总反应体系20ul:供鉴定的水仙基因组总DNA 50ng,10×PCR Buffer 2ul,10mmol/L dNTPs 0.5ul,10mmol/L水仙TA34上下游引物各1.0ul,5U/L Taq DNA聚合酶 0.2ul,无菌ddH2O 12.8ul;所述供鉴定的水仙,本发明共提供24份水仙品种样品;
(3)PCR扩增程序:94℃预变性4min,94℃变性30s,52℃退火30s,72℃ 延伸45s,共35个循环,72℃延伸10min,4℃保存;
(4)聚丙烯酰胺凝胶电泳条件:1×TBE电泳缓冲液,体积比为8%的聚丙烯酰胺凝胶,在电压400V,电流100mA下电泳3.0h后用银染法染色,经ImageScanner Ⅲ凝胶扫描仪扫描保存;
(5)PCR扩增产物的检测鉴定:利用水仙BES-SSR标记引物TA34,对24份水仙的样品进行品种鉴定,于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的PCR扩增图谱中,在分子量为290bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙金盏银台;在分子量为209bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙重瓣玉玲珑;在分子量为298bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Replete;在分子量为233bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Alltruist;在分子量为235bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Jetfire;在分子量为168bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Tahiti;在分子量为282bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋裂冠水仙Orangerie;在分子量为189bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Yellow Cheerfulness;在分子量为303bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋红口水仙Recurvus ;在分子量为276bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Erlicheer ;在分子量为161bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋三蕊水仙Thalia;在分子量为234bp 的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Mount Hood;在分子量为177bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙White Favourite;在分子量为 273bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋长寿花水仙Silver Smiles;在分子量为281bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Pink Charm;在分子量为197bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Johann Strauss;在分子量为194bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Barret Browning;在分子量为293bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Dutch Master;在分子量为281bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Fortissimo;在分子量为205bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Daydream;在分子量为270bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Gay Tabor;在分子量为296bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋仙客来水仙Tete-a-Tete;在分子量为214bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Bella Vista;在分子量为274bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Carlton。
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