[发明专利]水仙BES-SSR标记引物TA34及鉴定水仙品种的方法有效

专利信息
申请号: 201310561494.6 申请日: 2013-11-13
公开(公告)号: CN103555851A 公开(公告)日: 2014-02-05
发明(设计)人: 祁世明;潘东明;林琳;郭志雄;潘腾飞 申请(专利权)人: 福建农林大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 蔡学俊
地址: 350002 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 水仙 bes ssr 标记 引物 ta34 鉴定 品种 方法
【权利要求书】:

1.一种水仙BES-SSR标记引物TA34,由上游引物TA34F和下游引物TA34R组成,其特征在于核苷酸序列如下:

TA34 F: 5'-GCTTTTCGCAAAAGATAGTGAG-3′

TA34 R: 5'-CGTGCCAAATAGTAAGGGGTC-3′。

2.利用如权利要求1所述的水仙BES-SSR标记引物TA34鉴定水仙品种的方法,包括水仙基因组总DNA提取、PCR总反应体系建立、PCR扩增程序、聚丙烯酰胺凝胶电泳条件和PCR扩增产物的检测鉴定,其特征在于:

(1)水仙基因组总DNA提取:利用改良的CTAB法提取水仙基因组总DNA;

(2)PCR总反应体系建立:总反应体系20ul:供鉴定的水仙基因组总DNA 50ng,10×PCR Buffer 2ul,10mmol/L dNTPs 0.5ul,10mmol/L水仙TA34上下游引物各1.0ul,5U/L Taq DNA聚合酶 0.2ul,无菌ddH2O 12.8ul;所述供鉴定的水仙,本发明共提供24份水仙品种样品;

(3)PCR扩增程序:94℃预变性4min,94℃变性30s,52℃退火30s,72℃ 延伸45s,共35个循环,72℃延伸10min,4℃保存;

(4)聚丙烯酰胺凝胶电泳条件:1×TBE电泳缓冲液,体积比为8%的聚丙烯酰胺凝胶,在电压400V,电流100mA下电泳3.0h后用银染法染色,经ImageScanner Ⅲ凝胶扫描仪扫描保存;

(5)PCR扩增产物的检测鉴定:利用水仙BES-SSR标记引物TA34,对24份水仙的样品进行品种鉴定,于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的PCR扩增图谱中,在分子量为290bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙金盏银台;在分子量为209bp的位置出现DNA条带,则该品种为中国多花水仙重瓣玉玲珑;在分子量为298bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Replete;在分子量为233bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Alltruist;在分子量为235bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Jetfire;在分子量为168bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Tahiti;在分子量为282bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋裂冠水仙Orangerie;在分子量为189bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Yellow Cheerfulness;在分子量为303bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋红口水仙Recurvus ;在分子量为276bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙Erlicheer ;在分子量为161bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋三蕊水仙Thalia;在分子量为234bp 的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Mount Hood;在分子量为177bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋多花水仙White Favourite;在分子量为 273bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋长寿花水仙Silver Smiles;在分子量为281bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Pink Charm;在分子量为197bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Johann Strauss;在分子量为194bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋小冠水仙Barret Browning;在分子量为293bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋喇叭水仙Dutch Master;在分子量为281bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Fortissimo;在分子量为205bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Daydream;在分子量为270bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋重瓣水仙Gay Tabor;在分子量为296bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋仙客来水仙Tete-a-Tete;在分子量为214bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Bella Vista;在分子量为274bp的位置出现DNA条带,则该品种为西洋大冠水仙Carlton。

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