[发明专利]甲亢易感性检测方法和试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及分子生物学和医学领域，具体涉及甲亢易感性检测方法和试剂盒。

背景技术

Graves’病（Graves’disease，GD），又称毒性弥漫性甲状腺肿伴甲亢，通常称为甲亢，是一种甲状腺激素（TH）分泌增多的、遗传与环境共同起作用导致的器官特异性自身免疫性疾病，是甲状腺功能亢进的最常见病因。甲亢临床上的典型特征包括弥漫性甲状腺肿、甲状腺功能亢进的系列表现、眼症以及胫前黏液水肿和指端粗厚。甲亢在临床上目前为免疫内分泌主要疾病之一，甲亢所引起的心衰、甲状腺危象的发生，常危及患者生命，致疾病预后不良。最近的调查显示中国人群的发病率为0.25～1.09%，估计患者约有1300万。亚洲人群的发病率较欧美和非洲人群发病率略高。

同胞对研究显示，同卵双胞胎患甲亢的一致率达36%，异卵双胞胎患病率为3%，甲亢发病的所有影响因素中遗传的比重占79%〔Brix,T.H.,Kyvik,K.O.,Christensen,K.&Hegedus,L.Evidence for a major role of heredity in Graves'disease:a population-based study of two Danish twin cohorts.J Clin Endocrinol Metab86,930-4(2001)〕。遗传因素在甲亢的发病机制中具有重要的作用。

甲亢的发病率存在着明显的男女差异。好发于生育年龄的女性，女性发病率大约是男性的5-10倍。在Turner综合征患者中甲亢的发病率很高，而Turner综合征是由于X染色体缺失或有其他异常导致的。研究也发现甲亢患者体内X染色体失活偏移发生率显著高于同年龄段的健康个体。这些现象一致提示X染色对甲亢发病有重要的影响。

近年来，单核苷酸变异(SNP)概念在多基因疾病研究中的广泛运用，同时，高通量、低成本的SNP检测手段的不断出现也为SNP大规模快速分型提供了可能。这为在分子水平上研究甲亢的发生和发展的机制开辟了全新的思路和手段。SNP的存在与否以及等位基因频率存在人种及地域的差异，这就提示多基因疾病遗传异质性的存在，即同一疾病或性状在不同的人群中可能是不同的遗传因素造成的。另外，不同人群中SNP类型和频率存在的这种差异也与不同人群对药物及环境因素的反应性不同密切相关。

甲亢作为一种遗传因素起较大作用的疾病，寻找易感基因基因进而阐明其遗传机制已经成为目前研究的热点。虽然已有许多关于遗传变异与甲亢的研究，但没有证实GPR174基因与甲亢相关性的报道，更没有证实本发明所述的GPR174基因SNP与甲亢相关性的报道。

综上所述，为了早期预防和诊断甲亢，本领域迫切需要寻找甲亢易感基因，并开发用于甲亢疾病预警的方法和试剂盒。

发明内容

本发明人运用Plink软件对X染色体的数据同常染色一样进行常规的Cochran Armitage趋势检验，没有发现X染色体上的易感基因。鉴于Plink软件常规Cochran Armitage趋势检验的方法对X染色体分析的缺陷，本发明人进一步用另外的两种方法（男女分层分析和Clayton的方法）对X染色体进行分析。两种关联分析的方法都显示一组存在着强LD关系的SNPs与GD相关。这些关联的SNPs位于Xq21.1区域，分布在GPR174基因及其周围区域。P值最低的SNP是距离GPR174基因约155-kb的rs5912838（P_{logistic regression}=4.60×10^-8;P_snpMatrix=1.36×10^-9;OR=1.80,95%CI1.48-2.18）。推定填补分析并没有在Xq21.1区域发现P值更低的SNPs。在这些关联的SNPs当中，rs3827440是一个导致GPR174发生非同义突变的SNP，它与P值最低的rs3827440之间存在着强的LD关系。虽然rs3827440不是这一区域P值最低的SNP，但是它是非常值得研究的功能变异。