[发明专利]一种诊断人类脊髓性肌萎缩症的荧光定量PCR试剂盒有效
申请号: | 201310616780.8 | 申请日: | 2013-11-27 |
公开(公告)号: | CN103614477A | 公开(公告)日: | 2014-03-05 |
发明(设计)人: | 徐湘民;周万军;李亮 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州市天河庐阳专利事务所 44244 | 代理人: | 胡济元 |
地址: | 510515 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 诊断 人类 脊髓 萎缩 荧光 定量 pcr 试剂盒 | ||
1.一种诊断人类脊髓性肌萎缩症的荧光定量PCR试剂盒,该试剂盒包括扩增引物和荧光探针,其特征在于,所述的扩增引物为,一对特异性扩增SMN1和SMN2基因的共用引物、一对特异性扩增NAIP基因的引物和一对特异性扩增参比序列的引物;所述的荧光探针为,特异性检测SMN1基因的荧光探针、特异性检测SMN2基因的荧光探针、特异性检测NAIP基因的荧光探针和特异性检测参比序列的荧光探针;其中,
(1)所述的一对特异性扩增SMN1和SMN2基因的共用引物中,
上游引物序列为:5’-CATCCATATAAAGCTATCTATATATAG-3’(SEQ NO.1),
下游引物序列为:5’-CTTAATTTAAGGAATGTGAGCACCT-3’(SEQ NO.2);
(2)所述的一对特异性扩增NAIP基因的引物中,
上游引物序列为:5’-TTGTGACTTATGAGCCGTACAGC-3’(SEQ NO.3),
下游引物序列为:5’-AGGCTACAGCAGAAGCACTGAAT-3’(SEQ NO.4);
(3)所述的一对特异性扩增参比序列的引物中,
上游引物序列为:5’-GAACACACATGTCAGAAGTCTAAG-3’(SEQ NO.5),
下游引物序列为:5’-ACCTCCAGTTAGATCTTCACTTCT-3’(SEQ NO.6);
(4)所述的特异性检测SMN1基因的荧光探针为:
5’-TTTGATTTTGTCTGAAACCCTGTAAGG-3’(SEQ NO.7),该探针的荧光素及其淬灭基团为5’-HEX,3’-BHQ1;
(5)所述的特异性检测SMN2基因的荧光探针为:
5’-TTTTGATTTTGTCTAAAACCCTGTAAGGA-3’(SEQ NO.8),该探针的荧光素及其淬灭基团为5’-FAM,3’-BHQ1;
(6)所述的特异性检测NAIP基因的荧光探针为:
5’-ATGGATACCACAGGAGATGGCG-3’(SEQ NO.9),该探针的荧光素及其淬灭基团为5’-CY5,3’-BHQ2;
(7)所述的特异性检测参比序列的荧光探针为:
5’-CAAATGCATCAGATTCCACAAGCT-3’(SEQ NO.10),该探针的荧光素及其淬灭基团为5’-ROX,3’-BHQ2。
(8)所述的参比序列为acctccagtt agatcttcac ttctaaagct aagtgagacc tgagacccat gtagacaccc aagaagcttg tggaatctga tgcatttggc ttagacttct gacatgtgtg ttc(SEQ NO.14),该序列位于NAIP基因端粒侧78kb处的GRCh37/hg19chr5:71107506-71107618区间。
2.根据权利要求1所述的一种诊断人类脊髓性肌萎缩症的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于,该试剂盒还包括DNA聚合酶、正常基因型对照gDNA标本、二氯化镁和dNTPs。
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