[发明专利]鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法及其专用标记

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法及其专用标记。

背景技术

小麦是世界上主要的粮食作物之一，小麦生产对我国粮食安全十分重要，寻找与高产相关的功能基因及其分子标记对未来小麦高产分子育种具有重要的理论意义和应用价值。小麦的产量主要由三个重要的构成因子决定：亩穗数、每穗粒数和粒重。粒重一般以千粒重表示，是小麦产量的主要构成因素之一，由粒长、粒宽和粒厚三因素协同作用，受数量性状基因控制（Ammiraju J S S,Dholakia B B,Santra D K,et al.Identification of inter simple sequence repeat(ISSR)markers associated with seed size in wheat.Theor Appl Genet,2001,102:726-732）。利用与小麦籽粒大小、粒重主效QTL紧密连锁的分子标记进行辅助选择，可以在很大程度上提高选择效率。在过去的十多年间，尽管在小麦的不同染色体上定位了许多千粒重QTLs（Ammiraju J S S,Dholakia B B,Santra D K,Singh H,Lagu M D,Tamhankar S A,Dhaliwal H S,Rao V S,Gupta V S,Ranjekar P K.Identification of inter simple sequence repeat(ISSR)markers associated with seed size in wheat.Theor Appl Genet,2001,102:726-732），但由于小麦是异源六倍体（2n=6X=42），基因组庞大（17.9×10⁹bp）、重复序列多（>80%），在小麦中直接克隆基因难度较大、周期长。

比较基因组研究发现，禾本科作物间存在着明显的共线性关系（Gale M D,Devos K M.Comparative genetics in the grasses.Proc Natl Acad Sci USA,1998,95:1971-1974）。作为禾本科作物的模式植物，水稻产量相关基因的克隆（Fan C,Xing Y,Mao H,Lu T,Han B,Xu C,Li X,Zhang Q.GS3,a major QTL for kernel length and weight and minor QTL for kernel width and thickness in rice,encodes a putative transmembrane protein.Theor Appl Genet,2006,112:1164-1171），为通过比较基因组学在小麦中进行产量相关基因同源克隆和功能研究奠定了基础。

单元型，也称单倍型，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合，或者说是一个染色单体里面具有统计学关联性倾向于以整体模式遗传给后代的一类单核苷酸多态性（SNPs）。利用单元型与表型性状进行关联分析优于单个SNP标记。目前，单元型多样性被越来越广泛地应用于群体遗传学研究，首先选择少量样本寻找和鉴定个体单元型，然后开发分子标记，在较大数量的样本中进行单元型分型，最后用所有分型样本进行单元型和表型的关联分析，希望找到具有功能的优异单元型，

从而服务于育种实践或进化等理论方面的研究。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法及其专用标记。

本发明提供了一种用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的试剂盒。

本发明所提供的用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的试剂盒，为如下（A）或（B）：（A）含有如下（a）-（c）；（B）含有如下（a）；

（a）引物对1和限制性内切酶BstNI；所述引物对1为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

（b）引物对2和引物对3；所述引物对2为由序列表中序列3和序列4所示的两条单链DNA分子组成的引物对；所述引物对3为由序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对；