[发明专利]一种基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法无效
申请号: | 201310656889.4 | 申请日: | 2013-12-06 |
公开(公告)号: | CN103667483A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 何农跃;习志江 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 | 代理人: | 冯慧 |
地址: | 210096 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 分离 hbsag 核酸 筛选 方法 | ||
1.一种基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,以Fe3O4磁性纳米颗粒为固相载体进行筛选,包括如下步骤:
步骤一、制备Fe3O4磁性纳米颗粒,在所述Fe3O4磁性纳米颗粒表面包覆一层硅壳,得到Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒,再对Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒表面羧基化修饰,得到羧基化Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒;
步骤二、对步骤一制备的羧基化Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒进行羧基活化,之后将活化的羧基化Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒与HBsAg偶联,得到偶联HBsAg的磁性纳米颗粒;
步骤三、将步骤二制备的偶联HBsAg的磁性纳米颗粒通过SELEX技术筛选特异识别HBsAg的核酸适体;
步骤四、将步骤三筛选出的产物进行克隆、测序,并对测序获得的HBsAg核酸适体进行二级结构分析预测。
2.根据权利要求1所述的基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,步骤三所述SELEX技术筛选特异识别HBsAg的核酸适体,包括如下步骤:将偶联HBsAg的磁性纳米颗粒与随机单链DNA文库进行孵育,并加入tRNA进行竞争结合,然后通过磁分离弃掉未结合的非特异性DNA序列,再将与HBsAg特异结合的DNA序列洗脱下来,然后以洗脱下的DNA序列为模版进行非对称性扩增,扩增出来的单链DNA作为下一轮筛选的文库,重复上述筛选过程;将最后一轮筛选出的DNA序列经PCR扩增及纯化后用于克隆、测序。
3.根据权利要求1或2所述的基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,步骤一所述Fe3O4磁性纳米颗粒采用软模板法制备,所述Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒经种子聚合法和经典法制备。
4.根据权利要求1或2所述的基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,步骤一所述Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒表面羧基化修饰是先将Fe3O4@SiO2磁性纳米颗粒表面氨基化,再利用丁二酸酐进行表面羧基化修饰。
5.根据权利要求1或2所述的基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,步骤二所述活化方法为碳化二亚胺一步法活化羧基。
6.根据权利要求1或2所述的基于磁分离的HBsAg核酸适体筛选方法,其特征在于,步骤四所述二级结构分析预测采用DNAMAN软件进行分析。
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