[发明专利]采用反转录环介导等温扩增技术检测芜菁花叶病毒的方法有效
申请号: | 201310659524.7 | 申请日: | 2013-12-03 |
公开(公告)号: | CN103789449A | 公开(公告)日: | 2014-05-14 |
发明(设计)人: | 赵磊;郝兴安;吴云锋 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
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地址: | 712100 陕西*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 采用 转录 环介导 等温 扩增 技术 检测 芜菁 花叶 病毒 方法 | ||
1.一种采用反转录环介导等温扩增技术检测芜菁花叶病毒(TuMV)的方法,其中该方法包括芜菁花叶病毒总RNA提取,RT-LAMP反应和实时浊度检测以及电泳检测,所述RT-LAMP反应采用的引物组如下:
引物组,用于TuMV病毒的RT-LAMP反应:
外引物(F3和B3):
SEQ ID NO.1:5’-CGGAACCTCCCCGAACAT-3’:
SEQ ID NO.2:5’-ATCGAGCTAAGCTCATGTCG-3’:
内引物(FIP和BIP):
SEQ ID NO.3:5’-GTTTGGCGTGGTCAATGAGCGAAACGGAATGTGGGTGATGA-3':
SEQ ID NO.4:5’-GGCCCATTTCAGTGACGTAGCTCTGAAGACCATATCGTGGCA-3’:。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述引物组包含所述全部4组引物SEQ ID NO.1-4。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,其中该方法包括如下步骤:
1)病毒总RNA的提取:
提取待测样品总RNA;
2)RT-LAMP反应:
使用外引物(F3和B3)和内引物(FIP和BIP)对病毒总RNA进行RT-LAMP反应,得到扩增产物;
3)浊度检测:
对扩增产物进行浊度观察,确定样品是否感染所述病毒;
4)电泳检测:
对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,获得病毒基因扩增产物条带,确定样品是否感染TuMV病毒。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,其中所述RT-LAMP反应中使用的引物浓度比例为:外引物(F3和B3):内引物(FIP和BIP)=0.2-0.4:1.2-1.6。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,其中所述RT-LAMP反应中的引 物浓度为外引物(F3和B3):内引物(FIP和BIP)=1:4。
6.权利要求3所述的方法,其特征在于,其中所述RT-LAMP反应中的反应温度为50-62℃。
7.权利要求6所述的方法,其特征在于,其中所述RT-LAMP反应中,TuMV引物使用的反应温度为62℃。
8.权利要求3所述的方法,其特征在于,其中所述RT-LAMP反应中的Mg2+浓度为高于或等于5mM。
9.权利要求8所述的方法,其中RT-LAMP反应中的Mg2+浓度为5mM。
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