[发明专利]过氧化氢酶基因标签单核苷酸多态性位点的挑选、检测及其应用有效
申请号: | 201310661025.1 | 申请日: | 2013-12-09 |
公开(公告)号: | CN103642921A | 公开(公告)日: | 2014-03-19 |
发明(设计)人: | 段朝霞;杨俊慧;张洁元;康建毅;陈魁君;李晓霞;陈继川;王建民;李兵仓 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第三军医大学第三附属医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆志合专利事务所 50210 | 代理人: | 胡荣珲 |
地址: | 400042 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 过氧化氢酶 基因 标签 核苷酸 多态性 挑选 检测 及其 应用 | ||
1.一种过氧化氢酶基因保护性单体型,其特征在于,由过氧化氢酶基因标签单核苷酸多态性位点rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972组成,该保护性单体型在所述位点的单核苷酸分别为:G、G、T、G、G、T。
2.一种过氧化氢酶基因危险性单体型,其特征在于,由过氧化氢酶基因标签单核苷酸多态性位点rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972组成,该危险性单体型在所述位点的单核苷酸分别为:A、G、T、C、A、C。
3.一种检测过氧化氢酶基因保护性单体型或过氧化氢酶基因危险性单体型的方法,其特征在于,该方法包括检测过氧化氢酶基因的标签单核苷酸多态性位点rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972。
4.一种体外检测噪音性耳聋相关基因的方法,其特征在于,该方法包括检测CAT基因的标签单核苷酸多态性位点:rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972。
5.一种体外检测待测样品中是否含有过氧化氢酶基因保护性单体型或过氧化氢酶基因危险性单体型的方法,其特征在于,该方法包括:
1)提取待测样品的DNA,针对过氧化氢酶基因的标签单核苷酸多态性位点:rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972设计引物进行PCR扩增;
2)对扩增的PCR产物进行分析;
3)鉴定由rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972位点的单核苷酸多态性构成的单体型是否为:A、A、T、T、A、C;G、G、T、C、A、C;A、G、A、T、A、T;A、G、T、C、A、C或A、G、T、C、G、T;
4)根据步骤3)的结果确定待测样品中是否含有过氧化氢酶基因保护性单体型或过氧化氢酶基因危险性单体型。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤1)所述引物如SEQ ID NO:1-12所示。
7.一种体外预测待测个体患噪音性耳聋危险性的方法,其特征在于,该方法包括体外检测来自待测个体的样品中过氧化氢酶基因的标签单核苷酸多态性位点:rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972,其中携带上述位点的单体型A、G、T、C、A、C的个体患噪音性耳聋的危险性比携带单体型A、G、A、T、A、T;A、A、T、T、A、C;G、G、T、C、A、C或A、G、T、C、G、T的个体患噪音性耳聋的危险性显著升高。
8.一种检测过氧化氢酶基因的标签单核苷酸多态性位点的试剂盒,其特征在于,该试剂盒含有:
1)扩增rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972的引物;
2)PCR扩增酶及相应的缓冲液;
3)检测rs208679,rs10836233,rs2300182,rs769217,rs7104301和rs7949972位点的试剂。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述引物如SEQ ID NO:1-12所示。
10.权利要求8所述的试剂盒在检测个体患噪音性耳聋危险性中的应用。
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