[发明专利]一种柑桔衰退病毒全长侵染性克隆的构建方法及试剂盒无效
申请号: | 201310703583.X | 申请日: | 2013-12-19 |
公开(公告)号: | CN103642835A | 公开(公告)日: | 2014-03-19 |
发明(设计)人: | 周彦;周常勇;李中安 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院柑桔研究所 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N15/66 |
代理公司: | 重庆市前沿专利事务所(普通合伙) 50211 | 代理人: | 郭云 |
地址: | 400712 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 柑桔 衰退 病毒 全长 侵染 克隆 构建 方法 试剂盒 | ||
1.一种柑桔衰退病毒全长侵染性克隆的构建方法,包括以下步骤:
1)提取柑桔病株中柑桔衰退病毒分离株FS-577的总RNA;
2)以所述总RNA为模板,用随机引物反转录合成第一链cDNA;
3)用柑桔衰退病毒分离株FS-577的全序列设计的6对特异性引物,分段扩增所述步骤2中第一链cDNA的6个片段:cDNA片段1~6,所述的特异性引物的核苷酸序列分别为:
引物1上游引物序列ZYC214:
5’-CACTCGAGACAAACATCCCTGCCCAACGC-3’;
引物1下游引物序列ZYC1293:
5’-GCAGGATCCGTCGTACAGGGATCGTAATTAC-3’;
引物2上游引物序列ZYC749:
5’-AGTCCTCGAGAACCACTTAGTTGTTTAGCTATC-3’;
引物2下游引物序列ZYC1894:
5’-GCCGCACTAGTATTTAAATTGGACCTATGTTGGCCCCCCATAGGGACAGTG-3’;
引物3上游引物序列ZYC253:
5’-GTTCCGCATGCAGGAGTAAACACGTAGGTATGT-3’;
引物3下游引物序列ZYC1436:
5’-AGCTCCATGGTGGGGAGAAACGGATCTTCAT-3’;
引物4上游引物序列ZYC126:5’-CTTACTACGCCAACGCGAGCC-3’;
引物4下游引物序列ZYC1493:
5’-GAGCCCGCAGGACGCTGTGGAAAGATGCGT-3’;
引物5上游引物序列ZYC431:
5’-GGTAGATCTAGCGCGGAACAATTTTTTTCA-3’;
引物5下游引物序列ZYC1478:
5’-GCGGCTGCAGCTCGCAACCCGCCAGGA-3’;
引物6上游引物序列ZYC2158:
5’-CGAACAGGTTCAATTTGTGAAATTCCTCTCCAAATGAAATG-3’;
引物6下游引物序列ZYC114:5’-CCGGAATTCAGGCAGCTTGGGAAAT-3’;
4)将步骤3中扩增得到的cDNA片段1与双元载体pUC119-Δ9分别进行PmeI/PstI双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后得到35S-143;将35S-143与cDNA片段2分别进行PstI/SwaI双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后,得到35S-144;将35S-144与cDNA片段3分别进行XmaI/PmeI双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后得到35S-145;将35S-145与cDNA片段4分别进行XmaI/Bsu36I双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后得到35S-146;将35S-146与cDNA片段5分别进行Rsr II/Bsu36I双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后,得到35S-147;将35S-147与cDNA片段6分别进行Rsr II/AscI双酶切,双酶切产物经切胶纯化后混合进行链接,链接产物经转化、质粒纯化后,得到柑桔衰退病毒全长侵染性克隆35S-148。
2.根据权利要求1所述的一种柑桔衰退病毒全长侵染性克隆的构建方法,其特征在于:所述步骤3中PCR扩增的反应条件为94℃2min;94℃30sec,58℃45sec, 72℃,4min循环35次;最后72℃延伸10min,终止反应。
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