[发明专利]猪6号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点及其引物有效
申请号: | 201310727928.5 | 申请日: | 2013-12-26 |
公开(公告)号: | CN103757006A | 公开(公告)日: | 2014-04-30 |
发明(设计)人: | 张亚平;黄路生;谢海兵;任军;艾华水;徐丹 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明动物研究所;江西农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 昆明今威专利商标代理有限公司 53115 | 代理人: | 杨宏珍 |
地址: | 650223 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 染色体 上一个 产仔 相关 snp 及其 引物 | ||
1.猪6号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点,其特征在于:该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa10.2的Chr6:64826013,该位点的等位基因为T和C,有C/C、T/C和T/T三种基因型。
2.权利要求1的SNP位点,其中所述三种基因型特征在于:带有C/C基因型的猪产仔数高于带有T/C和T/T基因型的猪。
3.权利要求1的SNP位点,其中所述等位基因C为提高猪产仔数的有益等位基因。
4.权利要求1的SNP位点,其特征在于:该SNP位点及其侧翼序列如SEQ ID NO:1所示。
5.权利要求1-4的SNP位点,其中所述猪为太湖猪的后代。
6.以猪的DNA为模板扩增包含权利要求1-5所述SNP位点在内的核苷酸序列片段。
7.以猪的DNA为模板对包含权利要求1-5所述SNP位点在内的核苷酸序列片段进行测序。
8.扩增权利要求1所述SNP位点的引物及延伸引物为:
Chr6-2-PCRU:5’-GAC GGC CAA GCA GAA CAG-3’;
Chr6-2-PCRL:5’-TTG GGG CAG ATT AAT ATT TCA A-3’;
Chr6-2-SNPU:5’-ACT GAC TGA CTG ACT CTG ACA AGA ACG TGT
CCA CCG AGC C-3’。
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