[发明专利]一种分离微生物宏基因组DNA与总RNA的方法

说明书

技术领域

本发明涉及DNA和RNA分离技术领域，更具体的说，特别涉及一种分离微生物宏基因组DNA与总RNA的方法。

背景技术

目前，关于核酸同时提取的方法报道的已有很多，有针对无细胞壁的动物组织细胞(Deborah A.Triant，Andrew Whitehead.Simultaneous Extraction of High-Quality RNA and DNA from Small Tissue Samples[J].Joumal of Heredity，2009，100(2)：246-250)，有坚韧细胞壁的植物组织(刘胜洪，刘文，刘明峰，等.一种高效提取猕猴桃DNA和RNA的方法[J].生物技术通报，2011，9：171-175)，医学材料(M.Bauer,D.Patzelt.A method for simultaneous RNA and DNA isolation from dried blood and semen stains[J].Forensic Science International[J].2003，136(1-3)：76-78.)或其他环境样品(Carla M.Zammita，Lesley A.Mutcha,v,et al.The recovery of nucleic acid from biomining and acid mine drainage microorganisms[J].Hydrometallurgy,2011，108(1-2)：87-92)。但这些报道中应用的核酸分离法多为试剂盒分离或采用核酸酶处理。

采用试剂盒分离的成本较高，且在处理量较大超过吸附柱的承载量时回收率会降低，造成损失严重；采用酶处理时，虽然可以有效除去DNA中的RNA或RNA中的DNA，但是浪费比较严重，特别针对一些提取所得核酸总量较少的难取样或取样量有限的样品，可能会导致分析所需核酸量不足而需要扩增，而扩增常常就会导致分析结果的偏差或失真。但是，目前基于分子生物学分析的技术已经深入各个领域，如分析环境样品中的生物多样性和代谢多样性，生态系统中的群落动态变化与对环境因子的响应(Xie，J.，Z.He，X.Liu,etal.GeoChip-based analysis of the functional gene diversity and metabolic potential of microbial communities in acid mine drainage[J].Appl Environ Microbiol.2011.3(77)：991-999)，疾病诊断、监测和治疗，法医鉴定，生物酶的开发与生产等，相关的实验手段如：实时定量PCR技术(Han，J.S.，and C.G.Kim.Microbiological monitoring of acid mine drainage treatment systems and aquatic surroundings using real-time PCR[J].Water Sci Technol.2009.11(59)：2083-2091)、基因芯片技术(Guo，X.，H.Yin，J.Cong,et al.RubisCO gene clusters found in a metagenome microarray from acid mine drainage[J].Appl Environ Microbiol.2013.6(79)：2019-2026)和宏基因组测序技术(Auld，R.R.，M.Myre，N.C.Mykytczuk,et al.Characterization of the microbial acid mine drainage microbial community using culturing and direct sequencing techniques[J].J Microbiol Methods.2013.2(93)：108-115)等。然而这些分析均需以高质量的DNA或RNA为材料，故在核酸的提取与分离过程中既要保证完整性又要保证全面性。因此，有必要提供一种分离微生物宏基因组DNA与总RNA的方法，为分子生物学分析提供有利的技术支持，为宏基因组学或宏转录组学的分析奠定技术基础。

发明内容

本发明的目的在于提供一种成本低、回收率高、操作简单的分离微生物宏基因组DNA与总RNA的方法。

为了解决以上提出的问题，本发明采用的技术方案为：

一种分离微生物宏基因组DNA与总RNA的方法，包括以下步骤：