[发明专利]贝酵母耐硫杂交育种后代的鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201310738413.5 申请日: 2013-12-30
公开(公告)号: CN103740821A 公开(公告)日: 2014-04-23
发明(设计)人: 刘小珍;张汉尧 申请(专利权)人: 西南林业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 昆明科阳知识产权代理事务所 53111 代理人: 孙山明
地址: 650224 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 酵母 杂交育种 后代 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.贝酵母耐硫杂交育种后代的鉴定方法,包括以下步骤:

    (1)贝酵母杂交:参照Codon等(1995)的方法进行;

    (2)贝酵母菌株耐硫性测定:

将不同菌株接种于新鲜的含15 mg/L 亚硫酸钠的YPD(pH 3.5,含琥珀酸盐)上,能长起来的为耐硫菌株,不能长起来的为非耐硫菌株;

    (3)提取和纯化贝酵母DNA:

将菌种采用划线法接种到新的培养基上,获得单菌落;接种单菌落酵母到10mL酵母试管培养基中(YPD培养基),28℃,培养18h;取1.5mL酵母培养液,12000r/min离心1min收集菌体,加入600μL山梨醇buffer,5μL10U/μL溶菌酶(Lyticase),30℃处理30min;4000r/min离心10min,沉淀中加入200μL缓冲液GA重悬,加入20μL蛋白酶K混匀,加入4μL RNaseA(100mg/mL),室温放置5min;加入220μL缓冲液GB,颠倒混匀,70℃放置10min,加220μL 无水乙醇充分颠倒混匀,所得溶液和沉淀都加入吸附柱中,12000r/min离心30s,向吸附管中加入500μL缓冲液GD,12000r/min离心30s,向吸附柱中加入500μL漂洗液PW洗两次,最后加入30μLddH2O洗脱柱子上的酵母基因组DNA;

(4)组成PCR反应体系(单位:微升)配方:

                     2.5 微升 10×PCR buffer (包含 Mg2+),

                     1 微升的 10 mM 前导链引物

                     1 微升的 10 mM 后导链引物 

                     0.5 微升的10 mM of each dNTP

                     0.2 微升的5U/μL Taq DNA 聚合酶

                     2 微升 模板DNA

                     17.8微升  dH2O

      上述PCR反应体系以FZF1为基因扩增引物:L1: TAC GGG TTG ACC ACT CCA AT;R1: CAC CGC GTT CAT ATC ATC AG;

(5)PCR反应程序:①95℃5分钟;②95℃解链30钞;③60℃退火30秒;④72℃延伸60秒;⑤②-④35个循环;⑥72℃延伸7分钟;

(6)PCR产物用凝胶成像系统观察结果:经1.2%琼脂糖凝胶电泳,该琼脂糖凝胶含0.5 μg·mL-1的溴化乙锭,电压为3~5 V/cm,照像记录;

   (7)PCR产物测序:获得的序列用Vector NTI软件转化成FASTA格式,并用BLAST与NBCI数据库中的序列进行比对,鉴定结果:耐硫亲本只产生一条大小为1020bp的条带;而非耐硫亲本为一条700bp的条带。

2.根据权利要求1所述的鉴定方法,其特征是进一步以FZF1为基因扩增引物PCR分析筛选杂交后代,结果所筛选杂交后代特征突出,均表现为两条带。

3.根据权利要求1或2所述的鉴定方法,其特征是进一步用ISSR区分属于不同菌株的耐硫杂交后代:

(1)组成PCR反应体系配方:

2.5μL 10×PCR buffer (包含 Mg2+),

                      2μL的10 mM 引物,

                      0.5μL的10 mM dNTP,

                    0.2μL的5U/μL Taq DNA 聚合酶,

                     2μL 模板DNA,

                    12.8μL ddH2O;

ISSR引物如下:

(2)PCR反应程序为:①95℃5分钟;②95℃解链30秒;③56℃退火30秒;④72℃延伸60秒;⑤②-④40个循环;⑥72℃延伸7分钟;

(3)PCR产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳,该琼脂糖凝胶含0.5 μg·mL-1的溴化乙锭,电压为3~5 V/cm,用凝胶成像系统观察结果,并照像记录;

在鉴定结果中,不同单菌落如同属一菌株则ISSR图谱一致,如分属不同菌株则ISSR图谱不一致。

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