[发明专利]用于诊断肺癌侵袭性和遗传不稳定性的标记

权利要求书

1.一种用于诊断患者中肺癌侵袭性的方法，其包括以下步骤：

a)从所述患者的生物样本检测DNA复制应力基因标记的表达谱，所述标记包括CDC6、CLASPIN、PLK1和POLQ基因；

b)将步骤a)的表达谱与至少一种参考表达谱进行比较；以及

c)从所述比较中诊断肺癌为侵袭性或非侵袭性。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述标记还包括RAD51基因。

3.根据权利要求1至2中任一项所述的方法，其中通过测量所述标记的每个基因的表达水平进行根据步骤a)的表达谱检测。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中通过测量在参考样本中所述标记的每个基因的表达水平获得所述参考表达谱。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述参考表达样本是来自所述患者的健康肺组织样本。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中对于所述标记的每个基因通过计算在测试生物样本中的表达水平和参考样本中的表达水平之间的表达水平比来进行步骤b)的比较。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其中通过将获得的表达水平比与相应阈值进行比较来获得诊断。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其包括将所述标记的每个基因的表达水平对于对照基因的表达水平进行归一化的步骤。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述对照基因是管家基因。

10.根据权利要求9所述的方法，其中所述管家基因是选自B2M、TFRC、YWHAZ、RPLO、18S、GUSB、UBC、TBP、GAPDH、PPIA、POLR2A、ACTB、PGK1、HPRT1、IPO8和HMBS的基因。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述基因选自IPO8、HMBS、GUSB和UBC。

12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述表达水平在mRNA水平测量。

13.根据权利要求12所述的方法，其中所述表达水平使用定量PCR或微阵列技术进行测量。

14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述表达水平在蛋白水平测量。

15.根据权利要求14所述的方法，其中所述表达水平使用特异性抗体进行测量。

16.一种用于确定肺癌是否对使用放射疗法和/或化学治疗剂的治疗易感的方法，其包括：

a)使用根据权利要求1至15中任一项所述的方法诊断所述患者中所述肺癌是或不是侵袭性，以及

b)如果所述肺癌在步骤a)中诊断为侵袭性，则确定所述肺癌对使用所述放射疗法或化学治疗剂的治疗易感。

17.一种用于在患者中选择肺癌的合适治疗的方法，其包括：

a)使用根据权利要求1至15中任一项所述的方法诊断所述患者中所述癌是或不是侵袭性，以及

b)如果所述癌在步骤a)中诊断为侵袭性，则向外科治疗中增加辅助的放射疗法或化学治疗剂。

18.一种用于为患肺癌的受试者设计使用放射疗法和/或化学治疗剂进行治疗的方法，所述方法包括以下步骤：

a)使用根据权利要求1至15中任一项所述的方法诊断所述患者中所述肺癌是或不是侵袭性，以及

b)根据步骤a)的诊断确定放射疗法或化学治疗剂治疗的剂量。

19.一种调整患肺癌受试者的治疗的方法，所述治疗使用放射疗法或化学治疗剂，方法包括：

a)使用根据权利要求1至15中任一项所述的方法诊断所述患者中所述肺癌是或不是侵袭性，以及

b)根据步骤a)的诊断调整放射疗法或化学治疗剂治疗。

20.根据权利要求16至19中任一项所述的方法，其中所述化学治疗剂是DNA修复的抑制因子、DNA复制/损伤检验点的抑制因子、或DNA复制许可/起始的抑制因子。