[发明专利]浸润性和预后的乳腺癌生物标志物标签

说明书

发明人：Carlo M.Croce,Stefano Volinia

相关申请的交叉参考

本申请要求2012年1月20日提交的美国临时申请号61/588,790的利益，为了所有目的，将所述美国临时申请的完整公开内容通过引用明确地并入本文。

关于联邦政府资助的研究的声明

本发明是在国立卫生研究院授予的基金号U01-CA152758和U01-CA154200下由政府资助进行的。政府具有本发明的某些权利。

技术领域

本发明总地来说涉及分子生物学领域。更具体地，其涉及癌症相关技术。本发明的某些方面包括在乳腺癌的诊断、治疗和预后中的应用。

发明背景

乳腺癌(BC)是复杂疾病，特征在于遗传改变的异质性，并且受几个环境因子影响。原位导管癌(DCIS)是反映恶性细胞在乳腺导管内的增殖(而无穿过基膜的浸润)的异质性的病变群体。约80％的所有乳腺癌为浸润性导管癌(IDC)，这是最常见的BC类型。具有不同分子亚型(管腔A/B、HER2+和基底样)的乳腺肿瘤具有明显不同的mRNA特征谱。

直至1980年，DCIS很少被诊断，并且代表<1％的BC。随着乳房x线摄影术的使用增加，DCIS成为最快速增加的BC的亚组，在美国占据15％–25％的新诊断的BC病例。

MicroRNA(miRNA)是一类具有调节功能的保守非编码RNA，其在癌症中发挥重要作用。miRNA的微阵列分析近年来已产生许多新的知识。仍然存在对关于miRNA的功能和活性的信息以及可用于它们的表征和分析的方法及组合物的需要。然而，全基因组mRNA表达研究不能鉴定进展期特异性基因。

发明概述

在第一广泛方面，本文中描述了显示增加的不良预后乳腺癌的风险的乳腺癌标签。标签包括来自人受试者的组织的测试样品中miRNA/mRNA标签的水平变化的测定。在一个实施方案中，miRNA/mRNA标签由miRNA基因产物：hsa-miR-103、hsa-miR-1307、hsa-miR-148b、hsa-miR-324、hsa-miR-326、hsa-miR-328、hsa-miR-365、hsa-miR-484、hsa-miR-874a、hsa-miR-93；和mRNA基因产物：ADAT1、ANKRD52、BIRC6、C10orf18、C2CD2、CHD9、CHM、CPT1A、DAAM1、DIP2B、DPY19L3、FAM91A1、GMCL1、ME1、NCOA2、OTUD6B、PDSS2、PIK3CA、SMG1、TRIM23、TTC3、UBR5、UBXN7和ZFC3H1组成。测试样品的miRNA和mRNA基因产物的水平相对于无癌症组织的对照样品的对应miRNA和mRNA基因产物水平的变化表明人受试者具有不良的BC的存活预后。

在另一个方面，本文中提供了确定人受试者是否具有不良的乳腺癌(BC)存活预后的方法。方法通常包括测量来自人受试者的组织的测试样品的miRNA/mRNA标签的水平，其中所述miRNA/mRNA标签由miRNA基因产物：hsa-miR-103、hsa-miR-1307、hsa-miR-148b、hsa-miR-324、hsa-miR-326、hsa-miR-328、hsa-miR-365、hsa-miR-484、hsa-miR-874a、hsa-miR-93；以及mRNA基因产物：ADAT1、ANKRD52、BIRC6、C10orf18、C2CD2、CHD9、CHM、CPT1A、DAAM1、DIP2B、DPY19L3、FAM91A1、GMCL1、ME1、NCOA2、OTUD6B、PDSS2、PIK3CA、SMG1、TRIM23、TTC3、UBR5、UBXN7和ZFC3H1组成。方法通常还包括测定受试者的存活预后；其中测试样品的miRNA和mRNA基因产物水平相对于无癌组织的对照样品的对应miRNA和mRNA基因产物水平的变化表明人受试者具有不良的BC存活预后。