[发明专利]甲状腺癌生物标志物在审
申请号: | 201380014443.X | 申请日: | 2013-03-15 |
公开(公告)号: | CN104321439A | 公开(公告)日: | 2015-01-28 |
发明(设计)人: | S.田;X.曾;J.迪卡罗;J.俞;T.J.法希;V.德夫根;G.J.奎尔霍尔斯特;R.K.比安查 | 申请(专利权)人: | 凯杰科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 罗文锋;梁谋 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲状腺癌 生物 标志 | ||
1. 一种实时定量聚合酶链反应(qPCR)阵列,其包括:
a.一种或多种选自以下的甲状腺结节恶性肿瘤分类生物标志物:NPC2、S100A11、SDC4、CD53、MET、GCSH和CHI3L1;
b.一个或多个选自以下的参考基因:TBP、RPL13A、RPS13、HSP90AB1和YWHAZ;和
c.用于产生单一恶性肿瘤分数和可调整的截止阈值的相伴分类算法。
2. 权利要求1的qPCR阵列,包括3种或更多种甲状腺结节恶性肿瘤分类生物标志物和3个或更多个参考基因。
3. 权利要求1的qPCR阵列,包括5种或更多种甲状腺结节恶性肿瘤分类生物标志物和4个或更多个参考基因。
4. 权利要求1的qPCR阵列,包括甲状腺结节恶性肿瘤分类生物标志物NPC2、S100A11、SDC4、CD53、MET、GCSH和CHI3L1及参考基因TBP、RPL13A、RPS13、HSP90AB1和YWHAZ。
5. 权利要求1-4的任意之一的qPCR阵列,其中所述阵列中的NPC2用选自以下的基因替换:RXRG、CITED1、TGFA、GALE、KLK10、LRP4、CDH3、NAB2、HMGA2、DPP4、SDC4、TIPARP、S100A11、PSD3、LGALS3、RAB27A、ADORA1、TACSTD2、KLK11、DUSP4、TIMP1、PIAS3、CTSH、MRC2、SCEL、ABCC3、CHI3L1、TSC22D1、PROS1、QPCT、ODZ1、IGFBP6、RRAS、CAPN3、KRT19、SFN、ENDOD1、PLP2、PDLIM4、DOCK9、MAPK4、CDH16、KIT、MATN2、TLE1、ANK2、KIAA1467、COL9A3、TCFL5、TEAD4和SNTA1。
6. 权利要求1-4的任意之一的qPCR阵列,其中所述阵列中的S100A11用选自以下的基因替换:TIMP1、CHI3L1、SFN、LGALS3、MRC2、MVP、NPC2、DPP4、CYP1B1、TACSTD2、PROS1、FN1、RXRG、PDLIM4、DUSP6、CTSH、ABCC3、MTMR11、SDC4、IGFBP6、PLAUR、PIAS3、TIPARP、RRAS、ANXA1、QPCT、MAPK4、KIT、TLE1、KIAA1467、SNTA1、SORBS2和GPR125。
7. 权利要求1-4的任意之一的qPCR阵列,其中所述阵列中的SDC4用选自以下的基因替换:TACSTD2、MET、PDLIM4、SERPINA1、TIPARP、TGFA、TSC22D1、GALE、LGALS3、NPC2、CYP1B1、FN1、IL1RAP、KLK10、ZNF217、DUSP5、CTSH、ANXA1、CHI3L1、DPP4、MSN、RXRG、PROS1、SFN、BID、DUSP6、ENDOD1、DTX4、TIMP1、NRIP1、CD55、NAB2、PIAS3、S100A11、PRSS23、SCEL、LAMB3、CDH3、IGFBP6、CDC42EP1、HMGA2、ADORA1、SLC4A4、HGD、SORBS2、ELMO1、TFF3、TPO、KIT、ITPR1、MAPK4、FMOD、MT1F、FHL1、SLC39A14、TLE1、VEGFB、CDH16、SNTA1和ANK2。
8. 权利要求1-4的任意之一的qPCR阵列,其中所述阵列中的CD53用选自以下的基因替换:TMSB4X、SELL、CD86、CCR7、PLAUR、MYO7A、NFKBIE、S100B和ARHGEF5。
9. 权利要求1-4的任意之一的qPCR阵列,其中所述阵列中的MET用选自以下的基因替换:SDC4、TACSTD2、DTX4、IL1RAP、LGALS3、TGFA、GALE、KLK10、PARP4、HMGA2、PDLIM4、CHI3L1、SERPINA1、PROS1、TIPARP、FN1、ENDOD1、SLC39A14、HGD、ELMO1、TPO、SORBS2。
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