[发明专利]用于检测β球蛋白基因的变异的微阵列及其检测方法

权利要求书

1.一种探针，其特征在于，其为用于检测具有1个以上多态性的多核苷 酸序列的探针，与该序列杂交且至少满足以下条件之一，

(1)该序列的两端分别含有1个以上的不互补的碱基，

(2)在该序列中含有的多个多态性中，与非检测目的的多态性对应的部 分为通用碱基，

(3)检测目的的多态性位于距离探针的任一末端6碱基以下的位置。

2.一种探针，其特征在于，与具有1个以上多态性的多核苷酸序列杂交， 其中在该序列中鸟嘌呤及胞嘧啶的含量合计为63％以上，

该探针满足以下的(1)和/或(2)的特征，

(1)该序列的两端分别含有1个以上的不互补的碱基，

(2)在该序列中含有的多个多态性中，与非检测目的的多态性对应的部 分为通用碱基。

3.一种探针，其特征在于，与具有1个以上多态性的多核苷酸序列杂交、 且检测目的的多态性位于距离探针的任一末端6碱基以下的位置，其中，该序 列中鸟嘌呤及胞嘧啶的含量合计为45％以下。

4.根据权利要求1～3中的任一项所述的探针，具有1个以上多态性的多 核苷酸序列为人β球蛋白基因序列。

5.根据权利要求2所述的探针，鸟嘌呤及胞嘧啶的含量合计为63％以上 的、具有1个以上多态性的多核苷酸序列具有序列号3、4、7、8、17或18 所述的序列。

6.根据权利要求3所述的探针，鸟嘌呤及胞嘧啶的含量合计为45％以下 的、具有1个以上多态性的多核苷酸序列具有序列号11或12所述的序列。

7.一种微阵列，具有序列号3、4、7、8、11、12、17或18所述的序列 中的至少一者。

8.一种用于检测β球蛋白基因的变异的探针组，含有序列号3、4、7、8、 11、12、17、18、25～66所示的基因。

9.一种微阵列，具有序列号3、4、7、8、11、12、17、18、25～66所述 的序列中的至少一者。

10.一种β地中海贫血检测试剂盒，至少含有权利要求1～9中的任一项所 述的探针。

11.一种β地中海贫血检测试剂盒，含有权利要求7、9所述的微阵列。

12.一种β球蛋白基因变异检测用试剂盒，含有

(甲)(i)序列号21所示的寡核苷酸引物和序列号22所示的寡核苷酸 引物、和/或(ii)序列号23所示的寡核苷酸引物和序列号24所示的寡核苷酸 引物、以及

(乙)权利要求7或9所述的微阵列。

13.一种多态性检测用微阵列探针对的评价方法，含有以下的工序：

(1)在含有表示第1多态性检测用探针杂交而获得的信号强度的Y轴和 表示第2多态性检测用探针杂交而获得的信号强度的X轴的荧光坐标系中标 绘荧光坐标的工序，所述荧光坐标使第1多态性用对照核酸与多态性检测用探 针对杂交而获得；

(2)将反比于通过所述Y轴和X轴的交点O与所述工序(1)中标绘的 荧光坐标的直线的倾角的值设为校正值C的工序；

(3)对多个多态性检测用探针对进行工序(1)及(2)，在各探针间比 较校正值C，将校正值C为最小的探针对确定为适合于第1多态性检测的探针 的工序。

14.根据权利要求13所述的方法，所述荧光坐标系的所述Y轴和X轴正 交。

15.根据权利要求13或14所述的方法，所述工序(1)为进行2次以上 所述对照核酸和所述探针的杂交而获得2个点以上的荧光坐标来确定各坐标 的代表值M的工序；且

所述工序(2)中，所述直线为通过所述交点O和所述代表值M的中央 直线。