[发明专利]多路生化测定中信号的编码和解码有效

专利信息
申请号: 201380018760.9 申请日: 2013-02-01
公开(公告)号: CN104271767B 公开(公告)日: 2017-08-25
发明(设计)人: 埃米尔·P·卡尔塔洛夫;阿迪蒂亚·拉贾戈帕;阿克塞尔·谢勒 申请(专利权)人: 加州理工学院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司11262 代理人: 王思琪,郑霞
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 生化 测定 信号 编码 解码
【权利要求书】:

1.一种方法,所述方法能够不进行固定化、分离、质谱法、或解链曲线分析而非简并地检测单一样品体积中的、以存在或不存在的任意组合形式的至少7个分析物中的每个分析物的存在或不存在,其中所述方法包括:

(i)将待检测的每个分析物编码为信号的第一分量中的至少一个第一值和所述信号的第二分量中的至少一个第二值,从而产生编码方案;

(ii)枚举可以从所述编码方案获得的至少一个结果;

(iii)鉴定是简并的至少一个结果;和

(iv)从所述编码方案消除至少一个潜在的分析物代码,其中所述消除至少一个潜在的分析物代码减少或消除所述编码方案的结果的简并性,并且

其中所述方法能够明确地检测以存在或不存在的任意组合形式的M个分析物的存在或不存在,其中M=C*log2(F+1),其中C是用于编码所述分析物的所述第二值的数目,且F是当所有所述分析物存在时,关于任意第二值的所述信号的所述第一分量的最大累积值。

2.根据权利要求1所述的方法,其中M=log2(F+1)。

3.一种方法,所述方法能够不进行固定化、分离、质谱法、或解链曲线分析而非简并地检测单一样品体积中的、以存在或不存在的任意组合形式的至少7个分析物中的每个分析物的存在或不存在,其中所述方法包括:

(i)将待检测的每个分析物编码为信号的第一分量中的至少一个第一值和所述信号的第二分量中的至少一个第二值,从而产生编码方案;

(ii)枚举可以从所述编码方案获得的至少一个结果;

(iii)鉴定是简并的至少一个结果;和

(iv)从所述编码方案消除至少一个潜在的分析物代码,其中所述消除至少一个潜在的分析物代码减少或消除所述编码方案的结果的简并性,并且

其中,所述方法能够明确地检测以存在或不存在的任意组合形式的M个分析物的存在或不存在,其中M=(P*T)+1,其中P是编码方案中每层代码的数目,且T是层的数目,并且其中,所述层的数目T=log4(F+1),且F是当所有所述分析物存在时,关于任意第二值的所述信号的所述第一分量的最大累积值。

4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第一值是强度或强度的范围。

5.根据权利要求3所述的方法,其中,所述编码方案包括至少三个强度或强度的范围。

6.根据权利要求1所述的方法,其中,所述第二值是波长或波长的范围。

7.根据权利要求6所述的方法,其中,所述编码方案包括至少五个波长或波长的范围。

8.根据权利要求1所述的方法,其中,所述信号是电磁信号。

9.根据权利要求8所述的方法,其中,所述电磁信号是荧光发射信号。

10.根据权利要求9所述的方法,其中,测量了位于至少四个波长或波长的范围处的所述荧光发射信号的强度。

11.根据权利要求1所述的方法,其中,所述检测利用使用之前被冻干的试剂执行。

12.根据权利要求1所述的方法,其中,所述检测使用包括杂交探针的试剂执行。

13.根据权利要求12所述的方法,其中,所述杂交探针的数目大于所述分析物的数目。

14.根据权利要求12所述的方法,其中,所述杂交探针包括对不同分析物特异的一个或更多个杂交探针,且包括相同的荧光团或荧光团的组合。

15.根据权利要求12所述的方法,其中,所述单一样品与至少18个所述杂交探针接触。

16.根据权利要求12所述的方法,其中,所述试剂还包括能够扩增与至少三个所述杂交探针互补的区域的至少一对引物。

17.根据权利要求1所述的方法,其中,所述信号是在聚合酶链式反应中产生的。

18.根据权利要求17所述的方法,其中,所述聚合酶链式反应选自以下所构成的组:终点聚合酶链式反应、实时聚合酶链式反应、及数字聚合酶链式反应。

19.根据权利要求1所述的方法,其中,累积测量针对溶液执行。

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