[发明专利]用于预测从巴雷特食管到高度发育异常食管腺癌的进展的方法

说明书

技术领域

本发明涉及预测从巴雷特食管(Barrett’s Esophagus)到高度发育异常或食管腺癌的进展。特别地，本发明涉及用于辅助预测此进展的可能性的方法。

背景技术

胃食管反流可导致巴雷特食管(BE)，其中末端食道的鳞状上皮被替换成柱状上皮。3％的反流症状的内窥镜检查患者中发现了BE并且在所有接受内窥镜检查的患者中，1％的患者发现了BE(1，2)。BE的重要性在于其通过化生-发育异常-腺癌的续发事件进展至食管腺癌(EAC)的潜在可能性。EAC继续具有糟糕的预后，其五年整体存活率小于20％(3)。

基于最近的meta分析(4-6)和基于大量人群的研究，从非发育异常BE(NDBE)进展至EAC的速率在每年0.2-0.5％的区间内。这表明在一般人群中存在小但显著增长的相对风险。辅导单个患者是困难的，这是因为大多数患有NDBE的患者不会进展至EAC，并且目前，预测哪个患者具有风险的能力还十分有限(4)。这是本领域存在的问题。

用以监测从NDBE进展至发育异常或EAC的内窥镜监测计划是非常昂贵的，并且需要高度熟练的内窥镜医师。此外，其存在成本效益的问题，且其在降低癌症死亡率方面的价值还未得到证明。

越来越多的证据表明，大多数产生于BE的EAC的发生与染色体不稳定相关，其特征在于染色体数目的广泛不平衡(非整倍体/四倍体)和杂合性缺失。这些核型异常通常与在与癌症诱发和进展相关的特定肿瘤抑制基因和致癌基因中的突变的积累相关(7)。早期检测研究网络(EDRN)已确定一个通路，在将假定的生物标记物用于常规临床使用之前，必须通过此通路来验证该假定的生物标记物(8)。已经在代表性的2期和3期研究中鉴定出几种具有临床用于BE的潜力的生物标记物。先前已证实细胞周期蛋白A(增殖的细胞的比例的标志物)的表面表达与BE内的发育异常程度相关，并且可以使用组织化学进行评估(9)。先前通过流式细胞仪测量的DNA含量异常(非整倍体/四倍体)(10、11)也可以使用图像细胞计数DNA分析(DNA拷贝数)(可应用于石蜡切片)来进行精确的评估(12)。肿瘤抑制基因p53基因的失活已被鉴定为EAC进展中的关键事件，并且p53的双等位基因失活与EAC的后续进展相关(13)。

聚糖表达的协调变化已被证实发生于EAC的进展中。基因表达分析表明，大多数在进展至EAC的过程中最有助于聚糖通路的富集的基因在Lewis抗原的合成中起作用，已知Lewis抗原在其它癌症中改变了(16-18)。Lewis抗原的3期研究(使用免疫组织化学)确认了sLe^a(也称为CA19-9)和Le^x(CD15)的表达与BE内的发育异常程度相关。也通过凝集素组织化学证实了凝集素(特异性聚糖结合蛋白)小麦胚芽凝集素(WGA)和米曲霉(Aspergillus oryzae)凝集素(AOL)在进展至EAC的过程中具有高度显著降低的结合力。

在BE诊断中个体化进展风险的目标标记物将允许临床医生对具有高风险的患者进行靶向干预如内窥镜检查或微创治疗，而那些具有低风险的患者可以安心并避免了不必要且昂贵的后续跟进。但是，目前没有这样的个体化的风险评估，并且并不知晓从BE到EAC的进展中的可靠的分子预测物，这是本领域中的问题。

本发明旨在克服与现有技术相关的问题。

发明内容

从巴雷特食管(BE)进展至食管腺癌(EAC)的风险较低且难以预测。现有技术中不存在精确的风险预测工具。

本发明人考虑了通过WGA检测的包括sLe^a、Le^x、唾液酸残基和通过AOL检测的Fucα1-6GlcNAc残基的宽范围的候选标记物，以预测BE中进展至EAC的进程。此外，早期分子变化(其甚至早于发育异常的出现就被发现)被认为是进展至EAC的风险的可能的生物标记物。但是本领域中没有教导，任何此类标记物具有任何作为进展至EAC的关键参数的预测价值。通过设计一个研究来评估候选生物标记物在预测BE中肿瘤(neoplastic)进展过程中的性能以及创制生物标记物组(panel)作为风险分级工具，本发明人解决了这些问题。

本发明人公开了基于3期人群的研究，其揭示了用于巴雷特食管的新的风险分级生物标记物组。作为这项研究的结果，本发明人已经能够获得生物标记物的小且集中(focused)的组，其提供了对于进展至EAC而言具有稳健统计意义的预测工具。这种预测进展至EAC的新的能力本身就是显著的进步。此外，使用这一工具能进一步利于如优化监测和干预机制。