[发明专利]用于检测人乳头瘤病毒核酸的组合物和方法

说明书

优先权

本申请要求以下申请的优先权的权益：2012年10月11日提交的美国临时申请No.61/712,332，该申请的全部内容据此以引用方式并入本文中。

背景技术

人乳头瘤病毒(HPV)的感染目标是上皮组织，并且是多种癌症(主要为鳞状细胞癌和腺癌)的病因。与HPV相关的癌症包括头颈(喉、口腔、口咽、扁桃体和食道)、呼吸道组织、乳腺、皮肤、宫颈和肛门的癌症。虽然认为HPV感染是一些癌症发展的必要因素，但其他因素也可能影响癌变过程(Braakhuis et al.,J.Natl.Cancer Inst.96:998-1006,2004(Braakhuis等人，《美国国立癌症研究所杂志》，第96卷，第998-1006页，2004年)；Dahlstrand et al.,Anticancer Res.24:1829-35,2004(Dahlstrand等人，《抗癌研究》，第24卷，第1829-1835页，2004年)；Daling et al.,Cancer 101:270-80,2004(Daling等人，《癌症》，第101卷，第270-280页，2004年)；Ha et al.,Crit.Rev.Oral Biol.Med.15:188-96,2004(Ha等人，《口腔生物医学与医学鉴定性评论》，第15卷，第188-196页，2004年)；Hafkamp et al.,Acta Otolaryngol.124:520-6,2004(Hafkamp等人，《耳鼻喉科学报》，第124卷，第520-526页，2004年)；Harwood et al.,Br.J.Dermatol.150:949-57,2004(Harwood等人，《英国皮肤病学杂志》，第150卷，第949-957页，2004年)；Rees et al.,Clin.Otolaryngol.29:301-6,2004(Rees等人，《临床耳鼻喉科学》，第29卷，第301-306页，2004年)；Widschwendter et al.,J.Clin.Virol.31:292-7,2004(Widschwendter等人，《临床病毒学杂志》，第31卷，第292-297页，2004年))。

已鉴定出至少77种不同类型的HPV。在它们中，HPV16和HPV18在很多情况下与多种HPV相关癌症有关联，但是与HPV类型相关的风险等级可随乳头瘤相关癌症的不同形式而变化。已研究了人乳头瘤病毒在上皮细胞中的发病机理以阐明HPV感染与癌症的联系。HPV感染复层上皮细胞的基底层细胞，在此处它们以多拷贝附加体或整合基因组的形式定殖，病毒DNA凭借所述多拷贝附加体或整合基因组随同细胞染色体一起复制(由Longworth et al.,Microbiol.Mol.Biol.Rev.68:362-72,2004(Longworth等人，《微生物学与分子生物学评论》，第68卷，第362-372页，2004年)综述)。在细胞分裂时，子细胞迁移离开基底层并经历分化，在分化过程中，HPV营养期病毒复制和晚期基因表达被激活，从而产生子代HPV。虽然被感染个体的免疫系统通常可在1至2年内将HPV感染清除，但被感染的基底细胞可能存留几十年。HPV感染可导致染色体的不稳定性和非整倍性，这些性质可有利于HPV整合(Melsheimer et al.,Clin.Cancer Res.10:3059-63,2004(Melsheimer等人，《临床癌症研究》，第10卷，第3059-3063页，2004年)；Reidy et al.,Laryngoscope 114:1906-9,2004(Reidy等人，《喉镜》，第114卷，第1906-1909页，2004年))。在HPV基因组整合期间，HPV E2基因可能被破坏，导致编码靶向调节蛋白pRb和p53的癌蛋白的HPV E6/E7致癌基因的表达失调。因此，对细胞调节进行调控的一连串事件可能导致癌变(Braun et al.,Cancer Lett.209:37-49,2004(Braun等人，《癌症快报》，第209卷，第37-49页，2004年)；Fan et al.,Crit.Rev.Eukaryot.Gene Expr.14:183-202,2004(Fan等人，《真核状态基因表达评论综述》，第14卷，第183-202页，2004年)；Fiedler et al.,FASEB J.18:1120-2,2004(Fiedler等人，《美国实验生物学联合会会刊》，第18卷，第1120-1122页，2004年)；Psyrri et al.,Cancer Res.,64:3079-86,2004(Psyrri等人，《癌症研究》，第64卷，第3079-3086页，2004年)；Si et al.,J.Clin.Virol.32:19-23,2004(Si等人，《临床病毒学杂志》，第32卷，第19-23页，2004年))。