[发明专利]在固相设备上分离和分析核酸分子的非标记方法有效
申请号: | 201380072172.3 | 申请日: | 2013-12-13 |
公开(公告)号: | CN104968803B | 公开(公告)日: | 2019-07-26 |
发明(设计)人: | 愼鏞;朴美敬 | 申请(专利权)人: | 第一生物医学私人有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 | 代理人: | 唐述灿 |
地址: | 新加坡新加*** | 国省代码: | 新加坡;SG |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 设备 分离 分析 核酸 分子 标记 方法 | ||
1.一种在固相设备上分离和/或分析核酸分子的方法,包括:
(i)将核酸样品与已二亚胺二甲酯(DMA)在能形成该核酸与该DMA的复合体的条件下进行温育;
(ii)使(i)的该复合体与该固相设备的胺化的表面接触;以及
(iii)通过使用pH>10的洗脱液来将该核酸与该DMA的复合体与所述表面分离,和/或分析该复合体中的该核酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,用蛋白酶提取该核酸样品。
3.根据权利要求2所述的方法,其中,该蛋白酶为蛋白酶K。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其中,该核酸包括甲基化的DNA。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,该固相设备为微流体设备。
6.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其中,该固相设备为环形谐振器。
7.根据权利要求6所述的方法,还包括:
(i)确定输出光强度,该输出光强度由光学传感系统的检测器测定;
(ii)在温育过程中,确定光学传感系统的谐振器的有效折射率的变化。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,所述环形谐振器包括波导结构。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中,该复合体在非甲基化胞嘧啶残基处被修饰。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法,其中,该复合体或该被修饰的复合体被扩增。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法,其中,该复合体或该被修饰的复合体被检测。
12.一种用于分离核酸样品中的目标核酸分子的系统,包括:
(i)用于与该核酸分子直接结合以在该核酸分子与DMA化合物之间形成复合体的已二亚胺二甲酯(DMA)化合物;
(ii)用于该核酸分子和该DMA化合物的相互作用以在其上形成复合体的胺化的固体表面;以及
(iii)pH>10的洗脱液,其中,
(A)该固体表面在环形谐振器上,该环形谐振器为光学检测传感器,其中当所述核酸分子与所述DMA结合时,所述检测传感器的读数发生变化,从而使得所述传感器被配置为感测在该核酸分子与该DMA之间形成的复合体;和/或
(B)该系统不包括用于结合该核酸分子的DMA交联蛋白媒介物。
13.根据权利要求12所述的系统,其中,该系统还包括蛋白酶。
14.根据权利要求13所述的系统,其中,该蛋白酶为蛋白酶K。
15.根据权利要求12所述的系统,其中,该固体表面在微流体设备上。
16.根据权利要求12所述的系统,其中,光学检测传感器被配置为在谐振波长处谐振。
17.根据权利要求16所述的系统,还包括可调谐激光器,该可调谐激光器可为该光学传感器提供处于所述谐振波长的光。
18.根据权利要求12-17中任一项所述的系统,其中,该光学传感器或环形谐振器包括波导结构。
19.根据权利要求12-17中任一项所述的系统,其中,当所述核酸分子与所述DMA结合形成所述复合体时,所述谐振器具有偏移的谐振波长。
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