[发明专利]预测移植物供体珍珠牡蛎的生物矿化能力的标志

说明书

技术领域

本发明涉及珍珠养殖的领域。本发明更具体地涉及移植物供体珍珠牡蛎的生物矿化能力的预测标志。本发明还涉及一种包含根据本发明的标志的具有高生物矿化能力的珍珠牡蛎。

背景技术

珍珠养殖是一项涉及在天然环境中养殖珠母贝属种(Pinctadasp.)珍珠牡蛎以生产养殖珍珠的人类活动。在第一步骤中，采集将被用于供体牡蛎或接受体牡蛎的珍珠牡蛎并且对这些珍珠牡蛎进行培育以达到为成功移植所需的发育水平。移植是一种外科手术，在所述外科手术中，将移植物——即供体牡蛎的外套膜的一部分(约4mm²)——连同珍珠母珠粒(即核)一起插入到接受体牡蛎的珍珠囊袋(pearlpouch)中。在被插入到接受体珍珠牡蛎中之后，所述移植物的矿化上皮边缘增殖并且内衬于所述珍珠囊袋以形成珍珠囊，所述珍珠囊围绕所述核。所述珍珠囊然后使珍珠母层在核周围沉积，从而形成珍珠(Cochennec-Laureau等,AquaticLivingResource,2010:23,131-140)。

据估计，所生产的珍珠当中平均仅有3％至5％具有非常高的品质。大部分的珍珠具有表面缺陷、不均匀的颜色或过薄的珍珠母厚度。由于珍珠养殖在经济上的重要性，特别是在法属波利尼西亚(FrenchPolynesia)，因此需要使得所生产的高品质珍珠的百分比能够提高的工具或方法。

为了鉴定具有使得能够生产高品质珍珠的特定特性的供体珍珠牡蛎或接受体珍珠牡蛎，已经利用了遗传学方法，特别是基因组学和转录组学方法。

Wada和Komaru(Aquaculture,1996,142:25-32)的研究工作由此已经使得有可能对“供体效应”进行观测，该效应对应于供体珍珠牡蛎对珍珠的特征、特别是对它们的颜色和光泽的影响。

美国专利US7163795描述了一种用于鉴定能够表达蛋白质珍珠母素(Nacrein)(一种构成珍珠母并且潜在地参与生物矿化过程的蛋白质)的牡蛎的方法，所述方法可以用于珍珠养殖中。该专利还描述了一种用于鉴定形成珍珠的最佳条件的方法，所述方法包括分析珍珠母素的表达。然而，由于珍珠养殖在传统上是在开放的海域上进行的，因此似乎难以对养殖条件进行调整。

在连续两项研究中，Inoue等描述了所生产的珍珠的品质与参与珍珠囊中的生物矿化的六种基因的基因表达谱之间的关系(Inoue等,ZoologicalScience,2011,28:32-6；Inoue等,MarBiotechnol.,2011,13:48-55)。由Inoue等所呈现的结果构成了对以下的首次证实：参与生物矿化过程的基因的表达水平可能与所获得的珍珠的品质具有相关性。

在2011年，Kinoshita等公布了通过转录组学方法对参与合浦珠母贝(Pinctadafucata)中的生物矿化的基因进行鉴定的一项大规模研究的结果(Kinoshita等,PLoSOne,2011；6(6):e21238)。然而，这项研究没有确立基因表达与珍珠品质之间的关系。

为了鉴定具有高生物矿化能力的移植物供体珍珠牡蛎，本申请的发明人进行了大规模的转录组学研究和蛋白质组学研究，并且分析了在实验性移植期间(1)基因表达谱与(2)品质和生长(珍珠母厚度)之间的关系。这项研究使得他们能够鉴定预测珍珠品质的特定基因标志。

发明内容

本发明因此涉及移植物供体牡蛎的生物矿化能力的预测标志，所述标志包含至少两种生物标志物的表达谱，所述生物标志物包含以下核苷酸序列或由以下核苷酸序列组成，所述核苷酸序列选自SEQIDNO:1至SEQIDNO:42、其变体以及片段。

根据一个实施方案，所述标志预测使用所述供体牡蛎所获得的珍珠的商业品质和/或在核周围的珍珠母沉积速率。

本发明还涉及通过使用供体牡蛎所获得的珍珠的商业品质和/或使用所述供体牡蛎在核周围的珍珠母沉积速率的预测标志，所述标志包含在所述供体牡蛎的外套膜中的至少一种生物标志物的表达谱，所述生物标志物包含以下核苷酸序列或由以下核苷酸序列组成，所述核苷酸序列选自SEQIDNO:1、4、5、8、11、14、18、23、26、27、28、36、39、40和42、其变体以及片段。