[发明专利]通过与环己烷羧酸合成相关的碳链延伸生产7碳化学物的方法

权利要求书

1.一种用于生物合成选自下组的产物的方法：庚二酸、7-氨基庚酸、7-羟基庚酸、庚二胺和1,7-庚二醇，所述方法包括使用与环己烷羧酸生物合成或2-氨基己二酸赖氨酸生物合成途径相关的酶酶促合成七碳链式脂族主链，以及在所述主链中酶促形成一个或两个选自下组的末端官能团：羧基、胺和羟基基团，从而形成所述产物。

2.权利要求1的方法，其中所述七碳链式脂族主链是庚二酰-CoA。

3.权利要求1或2的方法，其中通过3-酮庚二酰-CoA从乙酰-CoA或2-氧代戊二酸酶促合成庚二酰-CoA。

4.权利要求3的方法，其中β-酮硫解酶或β-酮脂酰[acp]合酶将戊二酰-CoA转化为3-酮庚二酰-CoA。

5.权利要求4的方法，其中使用戊烯二酰-CoA脱羧酶或戊二酰-CoA脱氢酶从巴豆酰-CoA生产戊二酰-CoA。

6.权利要求3-5任一项的方法，其中使用3-羟基己二酰-CoA脱氢酶将3-酮庚二酰-CoA转化为3-羟基庚二酰-CoA。

7.权利要求6的方法，其中由6-氧代-环己-1-烯-羰基-CoA水解酶将3-羟基庚二酰-CoA转化为6-酮环己-1-烯-1-羰基-CoA。

8.权利要求7的方法，其中由烯酰-CoA水合酶将3-羟基庚二酰-CoA转化为2,3-脱氢庚二酰-CoA。

9.权利要求1-8任一项的方法，其中所述两个末端官能团是相同的。

10.权利要求1-8任一项的方法，其中所述两个末端官能团是不同的。

11.权利要求10的方法，其中所述产物包含末端胺和末端羧基基团。

12.权利要求10的方法，其中所述产物包含末端羟基基团和末端羧基基团。

13.权利要求1-9任一项的方法，其中所述两个末端官能团是胺。

14.权利要求1-9任一项的方法，其中所述两个末端官能团是羟基基团。

15.权利要求12或14的方法，其中6-羟基己酸脱氢酶、5-羟基戊酸脱氢酶、4-羟基丁酸脱水酶、或醇脱氢酶酶促形成所述两个羟基基团。

16.权利要求1-14任一项的方法，其中硫酯酶、醛脱氢酶、7-氧代庚酸脱氢酶、6-氧代己酸脱氢酶、CoA-转移酶、或可逆CoA-连接酶酶促形成末端羧基基团。

17.权利要求16的方法，其中所述硫酯酶与列于SEQIDNO:1中的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

18.权利要求11或13的方法，其中ω-转氨酶或脱乙酰基酶酶促形成所述胺基团。

19.权利要求18的方法，其中所述ω-转氨酶与列于SEQIDNO.8-13中的任一氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

20.权利要求1-14任一项的方法，其中羧酸还原酶和磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶增强剂组合形成末端醛基团，作为形成所述产物的中间物。

21.权利要求20的方法，其中所述羧酸还原酶与列于SEQIDNO.2-7中的任一氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

22.前述权利要求任一项的方法，其中所述方法通过发酵在重组宿主中进行。

23.权利要求22的方法，其中所述宿主经历厌氧、微氧或混合的氧/反硝化培养条件下的培养策略。

24.权利要求22或23的方法，其中所述宿主在营养限制的条件下培养。

25.根据权利要求22-24任一项的方法，其中所述宿主使用陶瓷中空纤维膜保留以维持发酵期间的高细胞密度。

26.权利要求22-25任一项的方法，其中最终电子受体是硝酸盐。

27.权利要求22-26任一项的方法，其中对发酵进料的主要碳源衍生自生物或非生物给料。