[发明专利]一种构建TAL效应子和TALENs的简化方法及质粒有效
申请号: | 201410032382.6 | 申请日: | 2014-01-23 |
公开(公告)号: | CN103805624A | 公开(公告)日: | 2014-05-21 |
发明(设计)人: | 赵开军;王春连;郑崇珂;张晓平;王福军;秦腾飞 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12N15/66 | 分类号: | C12N15/66;C12N15/63;C12N15/74 |
代理公司: | 北京知本村知识产权代理事务所 11039 | 代理人: | 刘江良 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 构建 tal 效应 talens 简化 方法 质粒 | ||
1.一种通用载体pSK-RAR-U的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
第一步,以含有avrXa23基因的pBluescript SK+质粒即pSK-avrXa23质粒DNA为模板,分别用引物对TalenF1/TalenR1、TalenF2-U/TalenR2进行PCR扩增,将扩增出的两个PCR产物混合作模板,再用引物对TalenF1/ TalenR2进行搭桥PCR;
第二步,将扩增出的片段回收,与pEASY-Blunt载体重组连接,测序正确的克隆用SphI酶切;
第三步,将酶切片段克隆到中间载体pSK-avrXa23ΔSphF-XH载体,构建成通用的重复可变区受体质粒载体,命名为pSK-RAR-U;
其中,所述TalenF1、TalenR1、TalenF2-U、TalenR2的序列分别是SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.15;
其中,所述中间载体pSK-avrXa23ΔSphF-XH载体构建方法如下:
(1) 将(pSK-avrXa23用SphI酶切,去除SphI酶切的DNA片段,将含有avrXa23的N端和C端DNA序列的载体在T4连接酶作用下自连,形成的载体命名为pSK-avrXa23ΔSphF,其中avrXa23没有SphI片段;
(2) 用引物avrXa23F6和avrXa23R6,以pSK-avrXa23ΔSphF载体为模板进行PCR扩增,扩增片段重组到pBluescript II SK的SmaI酶切线性DNA上,形成的中间载体即为pSK-avrXa23ΔSphF-XH;所述引物avrXa23F6和avrXa23R6的序列分别为SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5。
2.一种如权利要求1所述方法构建获得的通用载体pSK-RAR-U。
3.一种如权利要求2所述的通用载体pSK-RAR-U用于构建dTALEs表达载体的方法,其特征在于包括如下步骤:
第一步,dTALE重复区序列组装;
第二步,将dTALE重复区序列克隆到pSK-RAR-U中。
4.一种如权利要求3所述的方法,其特征在于:
第一步,装配识别A、T、G和/或C的dTALE重复区于中间载体中;
第二步,将中间载体用SpeΙ-NheΙ双酶切,并将含SpeΙ-NheΙ酶切片段回收,再克隆到pSK-RAR-U的NheΙ位点,即构建成dTALEs表达质粒载体。
5.如权利要求2所述的通用载体pSK-RAR-U、如权利要求3或4所述的方法在对生物基因组进行定点激活、敲除或修饰的dTALEs和TALENs方法中的应用。
6.如权利要求5所述的应用,其用于黄单胞杆菌属造成的作物病害。
7.如权利要求5所述的应用,其中所述作物是水稻,所述病害为白叶枯病或细菌性条斑病。
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