[发明专利]23个短串联重复序列的复合扩增体系及试剂盒

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及鉴定人类多个短串联重复序列的复合扩增体系，可以快速准确进行人类STR分型进而对法医个体识别和亲子鉴定提供依据。

背景技术

人类基因组STR（Short Tandem Repeats，短串联重复序列）是以几个碱基为核心单位串联重复形成的DNA遗传中较稳定存在的序列。不同种族、不同人群以及不同个体之间的区分是通过核心单位序列和重复数的差异，这也构成了STR的遗传多态性。在基因组中，平均每15～20kb就有一个STR位点，占基因组的10%，多存在于非编码区及内含子中，重复单位为2～6bp，重复次数10～60次，片段大小在70～500bp，并按孟德尔规律呈共显性遗传。因此STR复合扩增检测技术可以广泛应用于法医个体识别、亲子鉴定等领域。

自本世纪80年代中期以来,短串联重复序列(STR)检验已经成为法庭科学鉴定中最常用、发展最成熟的技术,，已被广泛地应用于各类案件检验。STR数据成为各国法庭科学数据库的主要构成，以便对犯罪嫌疑人进行对比和排查。

目前所采用的试剂盒大多数是以美国FBI选择的13个CODIS(Combined DNA Index System)：CSF1PO,FGA,TH01,TPOX,vWA,D3S1358,D5S818,D7S820,D8S1179,D13S317,D16S539,D18S51,D21S11为基础的CODIS位点试剂盒，但是在某些鉴定中，需要更多的非CODIS基因座提供更多的信息量。比如亲子鉴定、失踪人口比对以及近亲鉴定等案例时，检测的基因座数量较少的话，可能发生误判，尤其是亲子鉴定案例出现基因突变时，往往需要补充检测非CODIS基因座试剂盒，进一步提高系统的累积个体识别率和累积非父排除率。该系统所必须要求包含数量更多的非CODIS基因座，且基因座在中国人群具有更高的遗传多态性。

发明内容

针对上述领域中的不足，本发明提供一种23个短串联重复序列的复合扩增体系及试剂盒，本发明所采用的位点组合，提供了21个非CODIS基因座，是目前世界上系统效能最强大的非CODIS基因座检测系统，具有极高的个体识别率和非父排除率，本发明可用于法医个体识别、亲子鉴定以及群体遗传学分析，准确性更高，灵敏性好。

短串联重复序列的复合扩增体系，该复合扩增体系中包括22对引物，可同时扩增22个STR位点：D6S477、D18S535、D19S253、D15S659、D11S2368、D20S470、D1S1656、D22-GATA198B05、D16S539、D7S3048、D8S1132、D4S2366、D21S1270、D13S325、D9S925、D3S3045、D14S608、D10S1435、D12S1064、D2S1338、D17S1290和D5S2500，所述引物分别为：

所述扩增D6S477的上游引物序列如SEQ ID NO1所示，

所述扩增D6S477的下游引物序列如SEQ ID NO2所示；

所述扩增D18S535的上游引物序列如SEQ ID NO3所示，

所述扩增D18S535的下游引物序列如SEQ ID NO4所示；

所述扩增D19S253的上游引物序列如SEQ ID NO5所示，

所述扩增D19S253的下游引物序列如SEQ ID NO6所示；

所述扩增DD15S659的上游引物序列如SEQ ID NO7所示，

所述扩增D15S659的下游引物序列如SEQ ID NO8所示；

所述扩增D11S2368的上游引物序列如SEQ ID NO9所示，

所述扩增D11S2368的下游引物序列如SEQ ID NO10所示；

所述扩增D20S470的上游引物序列如SEQ ID NO11所示，

所述扩增D20S470的下游引物序列如SEQ ID NO12所示；

所述扩增D1S1656的上游引物序列如SEQ ID NO13所示，

所述扩增D1S1656的下游引物序列如SEQ ID NO14所示；

所述扩增D22-GATA198B05的上游引物序列如SEQ ID NO15所示，

所述扩增D22-GATA198B05的下游引物序列如SEQ ID NO16所示；

所述扩增D16S539的上游引物序列如SEQ ID NO17所示，