[发明专利]一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法有效
申请号: | 201410067044.6 | 申请日: | 2014-02-26 |
公开(公告)号: | CN103866009A | 公开(公告)日: | 2014-06-18 |
发明(设计)人: | 薛慧慧;肖君华;周宇荀;李凯 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 改进 引物 qrt pcr 检测 mirna 方法 | ||
1.一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,包括:
(1)miRNA检测引物的设计:
茎环引物包括两部分,通用的茎环序列和与靶标miRNA3’端互补配对的特异引物序列,其中与靶标miRNA互补配对的碱基数为11bp;
qPCR的下游引物针对通用的茎环序列,上游引物针对靶标miRNA的5’端;在所述上游引物的5’末端增加GC尾巴,以使上下游引物的退火温度相近;
(2)采用步骤(1)设计的miRNA检测引物将靶标miRNA反转录成cDNA;
(3)定量PCR扩增并采用SYBR Green qPCR检测法进行检测。
2.根据权利要求1所述的一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,其特征在于:步骤(1)中所述的靶标miRNA为miR-505-3P-RT1、miR-505-3P-RT2或miR-16-RT。
3.根据权利要求2所述的一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,其特征在于:所述的miR-505-3P-RT1对应的miRNA检测引物为:
PCR-F1:GCGAGCACCGTCAACACTTG;PCR-R1:TGGTGTCGTGGAGTCGGC。
4.根据权利要求2所述的一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,其特征在于:所述的miR-505-3P-RT2对应的miRNA检测引物为:
PCR-F2:GCGAGCACCGTCAACACT,PCR-R2:TGGTGTCGTGGAGTCGGC。
5.根据权利要求2所述的一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,其特征在于:所述的miR-16-RT对应的miRNA检测引物为:
PCR-F:CGCGCTAGCAGCACGTAAAT;PCR-R:GTGCAGGGTCCGAGGT。
6.根据权利要求1所述的一种改进的茎环引物qRT-PCR检测miRNA的方法,其特征在于:步骤(3)中所述的PCR扩增中PCR反应终体系20μL包括:10μL2×SYBR Green PCR master mix,0.4μL ROX,2.5μL cDNA模板,3μL PCR上下游引物2μM,4.1μL水,同时设阴性对照;PCR循环条件为95℃预变性2min,95℃变性15s,62℃延伸32s,共40个循环。
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