[发明专利]一种四重RT-PCR同时检测多种大蒜病毒的方法及其引物组合有效
申请号: | 201410092027.8 | 申请日: | 2014-03-13 |
公开(公告)号: | CN103911461A | 公开(公告)日: | 2014-07-09 |
发明(设计)人: | 胡新喜;熊兴耀;雷艳;汪沛;何长征;宋勇;汤琳菲 | 申请(专利权)人: | 湖南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京知本村知识产权代理事务所 11039 | 代理人: | 刘江良 |
地址: | 410128 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rt pcr 同时 检测 多种 大蒜 病毒 方法 及其 引物 组合 | ||
1. 一种四重RT-PCR同时检测多种大蒜病毒的方法,其特征在于,其步骤包括:
1)取大蒜叶片,提取其RNA;
2)以步骤1)得到的RNA为模板,通过反转录,得到cDNA;
3)以步骤2)得到的cDNA为模板,用四对引物对其进行PCR扩增;
4)PCR产物凝胶电泳,根据目的片段大小及阳性对照,判断病毒感染情况;
其中,所述引物如下:
青葱X病毒属病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.1所示;反向引物如SEQ ID NO.2所示;
检测洋葱黄矮病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.3所示;反向引物如SEQ ID NO.4所示;
检测韭葱黄条病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.5所示;反向引物如SEQ ID NO.6所示;
检测大蒜潜隐病毒和葱潜隐病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.7所示;反向引物如SEQ ID NO.8所示。
2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:四重PCR检测的反应体系,按50 μl计:2× PCR mix 25 μl、模板(cDNA)4 μl、四对引物的正向引物和反向引物各2 μl、超纯水补至所需体积。
3.按照权利要求1所述的方法,其特征在于四重PCR检测的PCR程序:92℃ 2min预变性后,40个循环参数为,92℃ 30s,42.5-45.6℃退火 30s,72℃ 1min,最后72℃ 10min。
4.按照权利要求1至3任一项所述的方法,其可以同时检测国内发现的大蒜主要病毒洋葱黄矮病毒(OYDV), 韭葱黄条病毒 (LYSV),葱潜隐病毒(SLV)、 GarV-A、GarV-B、GarV-C、GarV-D、GarV-E、GarV-X和ShV-X。
5.一种用于四重RT-PCR同时检测多种大蒜病毒的引物对组合,其特征在于:其由四对引物组合而成,所述引物分别如下:
青葱X病毒属病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.1所示;反向引物如SEQ ID NO.2所示;
检测洋葱黄矮病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.3所示;反向引物如SEQ ID NO.4所示;
检测韭葱黄条病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.5所示;反向引物如SEQ ID NO.6所示;
检测大蒜潜隐病毒和葱潜隐病毒的引物为:正向引物如SEQ ID NO.7所示;反向引物如SEQ ID NO.8所示。
6.按照权利要求5所述的引物对组合,其可以用于同时检测国内发现的大蒜主要病毒洋葱黄矮病毒(OYDV)、 韭葱黄条病毒 (LYSV)、葱潜隐病毒(SLV)、 GarV-A、GarV-B、GarV-C、GarV-D、GarV-E、GarV-X和ShV-X。
7.一种检测青葱X病毒属病毒的引物对,其特征在于:正向引物如SEQ ID NO.1所示;反向引物如SEQ ID NO.2所示。
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