[发明专利]一种用于梅花鹿皮肤松弛相关基因Fibulin-5基因点突变的检测试剂盒无效
申请号: | 201410095704.1 | 申请日: | 2014-03-13 |
公开(公告)号: | CN103820567A | 公开(公告)日: | 2014-05-28 |
发明(设计)人: | 陈秀敏;魏海军;杨镒峰;徐超;鞠妍;赵伟刚;崔学哲;薛海龙;赵蒙;李丹丽;安培培;曹新燕;宋兴超 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院特产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 130112 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 梅花鹿 皮肤 松弛 相关 基因 fibulin 突变 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明属于基因突变检测领域,具体涉及一种梅花鹿皮肤松弛相关基因Fibulin-5基因c.1030C>T和c.1081C>T突变的PCR检测试剂盒。
背景技术
人类皮肤松弛症是世界罕见疾病之一,是一种获得性和遗传性结缔组织异质性疾病,其特征是松散、多余的皮肤皱褶、下垂和弹性下降等。皮肤松弛症的患者皮肤容易松弛有褶皱,看起来未老先衰。皮肤松弛病征包括X-连锁、常染色体显性和隐性形式。而梅花鹿皮肤松弛症更加罕见。且这种梅花鹿产茸量极高,常常被用来作为种公鹿,但是在发情季节后颈部皮肤松弛更加严重,下垂很明显。一般认为,皮肤松弛症与遗传物质的改变有关。
Fibulin-5(FBLN-5)亦称为DANCE(developing arteries and neural crest EGF-like)或EVEC(embryonic vascular EGF-like repeat-containing protein),是Fibulin家族中的最新成员,是一个6.6万道尔顿的分子,是钙依赖性弹性蛋白结合蛋白,位于弹性蛋白-微纤维表面。在弹性纤维形成过程中发挥决定性作用。FBLN5基因,定位于人染色体14q31,广泛分布于富含弹性蛋白的组织里,属于整合糖蛋白,是一种细胞外基质蛋白,由448个氨基酸组成,有5个潜在的钙结合性表皮生长因子(EGF)样结构域。与αvβ3和αvβ5整合蛋白相互作用的特定细胞附着序列RGD(精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸arginyl-glycyl-aspartic acid)位点,位于N-末端不规则EGF域,将原弹性蛋白锚定于细胞表面,这对形成弹性纤维十分关键。Fibulin-5是弹性纤维发育过程中不可缺少的基因,在弹性蛋白聚合过程中,Fibulin-5作为弹性蛋白交联排列的支架,促进弹性蛋白交联形成弹性纤维。弹性纤维90%组分为原弹性蛋白,Fibulin-5能直接与原弹性蛋白结合,而原弹性蛋白还能促进Fibulin-5的表达。
Fibulin-5基因突变可以引起常染色体显性或者隐性遗传皮肤松弛症。如:人类皮肤松弛症患者Fibulin-5基因外显子7的纯合子n.679T>C的突变,在fibulin-5蛋白第四个EGF样结构域产生一种丝氨酸和脯氨酸代替物(p.S227P);外显子9的n.945T>C(rs2430347),改变了异亮氨酸315的编码,从ATT到ATC。
发明内容
本发明的目的在于,提供一种检测梅花鹿皮肤松弛症相关基因Fibulin-5基因突变的试剂盒,可用于检测Fibulin-5基因c.1030C>T和c.1081C>T突变位点。
检测梅花鹿皮肤松弛相关基因Fibulin-5基因突变的试剂盒,其特征在于,包括:(1)PCR扩增反应试剂:包括dNTP、10×PCR缓冲液、Mg2+、双蒸水、Taq酶等;(2)用于扩增样本cDNA中Fibulin-5基因突变位点1030和1081C>T的PCR引物上游引物F778:5’-ACACCGAAGGAGGCTACAC-3’,R1307:5’-CTCCTCACAGCGGATGGG-3’。
进一步地,所述试剂盒的使用方法包括如下步骤:(1)采集梅花鹿皮肤进行成纤维细胞培养后,提取总RNA,反转录为cDNA;(2)以该cDNA为模板,用所述用于扩增样本cDNA中Fibulin-5基因的PCR引物进行PCR扩增,PCR反应按以下条件进行扩增:94°C 5min;94°C 3Os,54°C 30s,72°C 1min、30个循环;72°C 7min。得到PCR反应产物;(3)对PCR反应产物测序,与Fibulin-5正常基因序列进行比较,确定是否存在第1030和1081位核苷酸发生C>T突变。
本发明试剂盒中用于扩增Fibulin-5基因的PCR引物,其中正向引物Fibulin-5的3’末端位于如序列SEQ ID NO.1所示的Fibulin-5基因编码区上游778bp处,反向引物Fibulin-5的3’端位于该编码区的下游约1307bp处,正反相引物大小分别为19bp,18bp,并能扩增梅花鹿Fibulin-5基因编码区495bp。
上述引物通过如下的方案进行设计:使用Primer 5软件协助设计引物,通过PCR扩增,将Fibulin-5编码区495bp扩增,然后进行直接测序,通过测序检测1030和1081C-T位点是否发生突变。
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