[发明专利]影响猪肉脂肪酸组分的主效SNP标记及其在种猪肉质性状遗传改良中的应用有效
申请号: | 201410100377.4 | 申请日: | 2014-03-18 |
公开(公告)号: | CN103911373A | 公开(公告)日: | 2014-07-09 |
发明(设计)人: | 任军;杨斌;麻骏武;张万昌;黄路生 | 申请(专利权)人: | 江西农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京聿宏知识产权代理有限公司 11372 | 代理人: | 欧颖;刘华联 |
地址: | 330045 江西省南*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 影响 猪肉 脂肪酸 组分 snp 标记 及其 种猪 肉质 性状 遗传 改良 中的 应用 | ||
1.一种影响猪肉脂肪酸组分的主效SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于猪14号染色体上的硬脂酰辅酶A脱氢酶基因(SCD基因)的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪14号染色体上g.120963718核苷酸位点,且其为C与T的突变,对应于SEQ ID NO:1上的第4513位,或所述SNP标记的位点为国际猪基因组10.2版本参考序列猪14号染色体上g.120963819核苷酸位点,且其为C与G的突变,对应于SEQ ID NO:1上的第4614位,前述两个位点完全连锁;并且所述SNP标记能够提高猪的单不饱和脂肪酸含量和/或降低饱和脂肪酸含量,所述单不饱和脂肪酸为C18:1和/或C16:1,所述饱和脂肪酸为C18:0和/或C16:0。
2.一种鉴定如权利要求1所述的SNP标记的引物,其特征在于,所述引物的序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
3.一种如权利要求1所述的SNP标记在种猪肉质性状遗传改良中的应用,且所述种猪肉质性状遗传改良包括提高猪的单不饱和脂肪酸含量和/或降低饱和脂肪酸含量。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述种猪为杜洛克猪或含有杜洛克血缘的猪。
5.与权利要求1的SCD基因中SNP标记的连锁不平衡程度(r2)大于0.8的SNP分子标记在种猪肉质性状遗传改良中的应用。
6.一种种猪遗传改良的方法,其特征在于,种猪继代选育国际猪基因组10.2版本参考序列猪14号染色体上g.120963718位点的TT型个体和/或其g.120963819位点的GG型个体,淘汰g.120963718位点的TC基因型和CC基因型个体和/或淘汰g.120963819位点的GC基因型和CC基因型个体。
7.一种检测猪的生产性状的方法,包括检测序列表中SEQ ID NO:1的5’端第4513位核苷酸为C还是T,或者检测检测序列表中SEQ ID NO:1的5’端第4614位核苷酸为C还是G,确定基因型,然后通过基因型确定生产性状;且所述猪的生产性状为单不饱和脂肪酸C18:1和/或C16:1含量的高低,或为饱和脂肪酸C18:0和/或C16:0含量的高低。
8.一种位于猪14号染色体上的SCD基因的核苷酸序列,所述序列为SEQ ID NO:1的第4513位由C突变为T且其4614位由C突变为G而得的序列;对应于国际猪基因组10.2版本参考序列猪14号染色体上g.120963718位点由C突变为T且其g.120963819位点由C突变为G而得的序列。
9.一种如权利要求8所述的核苷酸序列或SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列在与猪肉中单不饱和脂肪酸C18:1含量相关的种猪选育中的应用,优选所述种猪为杜洛克猪或含有杜洛克血缘的猪。
10.一对扩增SCD基因核苷酸序列片段的引物,其特征在于,上游引物的序列为如SEQ ID NO:2所示的序列,下游引物的序列为如SEQ ID NO:3所示的序列。
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